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Bioinformatique Perl

Forum Bioinformatique Perl

Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.

  1. maximum d'une entité dans un fichier

    Créée par Isabella83, 30/12/2011 17h08
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 595
    Isabella83
    04/01/2012, 14h14 Aller au dernier message

  2. Informations sur le métier de bioinformaticien

    Créée par Knaki, 19/11/2011 18h56
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 712
    Knaki
    30/11/2011, 21h54 Aller au dernier message

  3. BioPerl et fichier fastq

    Créée par pontarose, 28/10/2011 14h14
    • Réponses: 4
    • Affichages: 2 335
    Beniou
    29/11/2011, 13h43 Aller au dernier message

  4. problème pour lancer un blast avec bioperl

    Créée par alaninho, 23/11/2011 11h16
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 842
    mathgon
    24/11/2011, 14h59 Aller au dernier message

  5. Undefined subroutine &Bio::SearchIO called

    Créée par alaninho, 23/11/2011 11h13
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 821
    Beniou
    23/11/2011, 15h35 Aller au dernier message

  6. Can't locate Bio/Tool/GFF.pm in @INC

    Créée par alaninho, 23/11/2011 09h40
    • Réponses: 1
    • Affichages: 2 135
    alaninho
    23/11/2011, 09h42 Aller au dernier message

  7. Analyse de séquences

    Créée par Tomma, 16/11/2011 10h00
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 321
    stoyak
    19/11/2011, 20h02 Aller au dernier message

  8. analyse de contigs

    Créée par Jasmine80, 03/10/2011 13h37
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 535
    Jasmine80
    04/10/2011, 07h55 Aller au dernier message

  9. questions ur le software BioEdit

    Créée par Jasmine80, 16/08/2011 09h17
    • Réponses: 6
    • Affichages: 2 682
    mathgon
    07/09/2011, 10h43 Aller au dernier message

  10. module perl et dimères d'amorces

    Créée par Jasmine80, 16/08/2011 09h20
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 379
    Jasmine80
    16/08/2011, 09h20 Aller au dernier message

  11. obtenir la classification phylogenetique à partird'un rapport GenBank

    Créée par marie.lefebvre1608, 09/08/2011 19h20
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 983
    Jasmine80
    12/08/2011, 11h19 Aller au dernier message

  12. Débuter un projet de détermination de d'espèces

    Créée par marie.lefebvre1608, 10/06/2011 19h47
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 743
    -SKUD-
    03/08/2011, 11h27 Aller au dernier message

  13. question->existence module perl

    Créée par pontarose, 06/07/2011 17h27
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 577
    pontarose
    06/07/2011, 17h27 Aller au dernier message

  14. Bio::Tools::Run::Ensembl et Perl API ensembl

    Créée par Jasmine80, 05/07/2011 09h10
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 602
    Jasmine80
    05/07/2011, 09h10 Aller au dernier message

  15. récupération de séquences via Bio::DB::EntrezGene

    Créée par Jasmine80, 04/07/2011 14h10
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 577
    Jasmine80
    04/07/2011, 14h10 Aller au dernier message

  16. BLAST - serialisation

    Créée par fripette, 25/05/2011 11h19
    • Réponses: 2
    • Affichages: 19 018
    -SKUD-
    04/07/2011, 12h05 Aller au dernier message

  17. Comment trouver le degré de similitudes en deux fichiers ?

    Créée par khawlatunisienne, 04/07/2011 10h08
    • Réponses: 1
    • Affichages: 3 026
    -SKUD-
    04/07/2011, 11h31 Aller au dernier message

  18. Gbrowse - le retour !

    Créée par fripette, 19/04/2011 10h47
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 974
    a.tinakoua
    28/06/2011, 15h17 Aller au dernier message

  19. pogramme Primer Blast

    Créée par Jasmine80, 27/06/2011 14h35
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 560
    Jasmine80
    27/06/2011, 14h35 Aller au dernier message

  20. Comparaison de phylogénies

    Créée par mathgon, 31/05/2011 11h37
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 484
    mathgon
    31/05/2011, 11h37 Aller au dernier message

  21. dopage d'un fichier xgmml

    Créée par kmezhoud, 14/05/2011 11h35
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 074
    kmezhoud
    30/05/2011, 23h40 Aller au dernier message

  22. détermination de position

    Créée par joyeux2000, 02/05/2011 19h43
    • Réponses: 13
    • Affichages: 2 273
    joyeux2000
    20/05/2011, 21h41 Aller au dernier message

  23. Récupérer les titres des publications NCBI

    Créée par abysse, 20/05/2011 08h16
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 610
    abysse
    20/05/2011, 13h47 Aller au dernier message

  24. cancaténation des informations d'une même protéine trouvées dans de bases de données différentes uniproKB-HPDR

    Créée par kmezhoud, 14/05/2011 10h14
    1 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 953
    kmezhoud
    14/05/2011, 10h14 Aller au dernier message

  25. Bio: :Tools::Run::Pise Application: :msbar

    Créée par faktis, 04/05/2011 11h34
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 767
    faktis
    06/05/2011, 11h54 Aller au dernier message

  26. module Bio::Tools::Primer3 .

    Créée par Jasmine80, 12/11/2009 09h01
    • Réponses: 11
    • Affichages: 3 456
    pierrot-v
    20/04/2011, 15h13 Aller au dernier message

  27. Fonction de découpage de séquence pour l'étude de transcriptome

    Créée par faktis, 13/04/2011 16h37
    • Réponses: 22
    • Affichages: 3 508
    laura_
    18/04/2011, 16h49 Aller au dernier message

  28. Coverage, Blast, et BioPerl

    Créée par Noirham, 12/04/2011 10h13
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 839
    Noirham
    14/04/2011, 10h27 Aller au dernier message

  29. Sondage : les bioinformaticiens dans le monde de l'entreprise.

    Créée par Pirelith, 10/04/2011 18h13
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 800
    Pirelith
    10/04/2011, 18h13 Aller au dernier message

  30. thèse bio informatique

    Créée par joyeux2000, 03/04/2011 00h15
    • Réponses: 4
    • Affichages: 4 990
    Norore
    05/04/2011, 12h45 Aller au dernier message

  31. Calcul taille intergenique

    Créée par shadow19c, 22/03/2011 09h56
    • Réponses: 36
    • Affichages: 3 937
    shadow19c
    01/04/2011, 09h09 Aller au dernier message

  32. module de convertion d'identifiant de gène

    Créée par laura_, 22/03/2011 15h54
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 519
    laura_
    22/03/2011, 16h06 Aller au dernier message

  33. Construction hash intron

    Créée par shadow19c, 10/03/2011 17h12
    • Réponses: 25
    • Affichages: 3 552
    shadow19c
    20/03/2011, 18h10 Aller au dernier message

  34. Calcul distance genomique/proteique

    Créée par shadow19c, 07/03/2011 10h01
    • Réponses: 19
    • Affichages: 19 577
    djibril
    10/03/2011, 13h59 Aller au dernier message

  35. convertir fichier embl en fasta (embl2fasta)

    Créée par crazyarno, 11/12/2008 17h59
    1 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 10
    • Affichages: 21 861
    -SKUD-
    01/03/2011, 13h20 Aller au dernier message

  36. perl Bio::SeqIO=>récupérer la ligne entière

    Créée par pontarose, 16/02/2011 10h26
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 967
    pontarose
    16/02/2011, 11h26 Aller au dernier message

  37. Documentation BLAST UNIX

    Créée par Antwan76ers, 07/05/2010 16h13
    • Réponses: 4
    • Affichages: 2 767
    ben.IT
    12/02/2011, 21h01 Aller au dernier message

  38. Comment récupérer les données brutes des GEO Profiles d'un gène donné ?

    Créée par Norore, 09/02/2011 15h12
    • Réponses: 10
    • Affichages: 2 534
    Norore
    11/02/2011, 12h02 Aller au dernier message

  39. Localisation gènes sur GenBank

    Créée par dodup64, 03/02/2011 12h17
    • Réponses: 3
    • Affichages: 2 297
    Beniou
    04/02/2011, 17h33 Aller au dernier message

  40. protein accession to nucleotide accession au NCBI

    Créée par fripette, 01/02/2011 10h34
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 610
    fripette
    01/02/2011, 10h34 Aller au dernier message
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