Bonjour,
je suis actuellement face à un problème de taille, je cherche à récupérer, pour un gène donné (dont je connais le GeneID), les données brutes de ses GEO Profiles afin de pouvoir les analyser à coup de scripts. J'ai bien trouvé via le site du NCBI comment accéder aux profils pour un gène, malheureusement je ne vois pas comment récupérer les informations de façon automatisée et en données brutes de préférence.
Apparemment, d'après les CPAN, le module Bio:: DB::Expression devrait me permettre de trouver les GEO, mais je ne vois pas du tout comment cela fonctionne ni si il s'agit bien de ce que je cherche à réaliser ! A moins que je ne doive passer par la récupération de la banque de données GEO et par des scripts pour extraire les informations dont j'ai besoin...
L'un de vous a-t-il déjà rencontré cette problématique ? Si oui, comme a-t-il résolu l'affaire ?
Merci d'avance à la ou les personnes qui saura me venir en aide.
Cordialement, Norore.
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