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Bioinformatique Perl

Forum Bioinformatique Perl

Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.

  1. Amelioration perforformance pour script de filtration

    Créée par loula427, 01/02/2010 17h07
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 582
    loula427
    01/02/2010, 21h38 Aller au dernier message

  2. options (couleur) module clustalw

    Créée par angioedema, 27/01/2010 10h35
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 817
    angioedema
    27/01/2010, 10h35 Aller au dernier message

  3. pb avec clustalW

    Créée par Bioinfoe, 19/01/2010 19h59
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 782
    angioedema
    22/01/2010, 10h50 Aller au dernier message

  4. création de contigs

    Créée par Jasmine80, 21/01/2010 08h51
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 534
    Jasmine80
    21/01/2010, 08h51 Aller au dernier message

  5. Performances de BLAT

    Créée par Fol de Dol, 18/01/2010 12h05
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 635
    Fol de Dol
    18/01/2010, 14h24 Aller au dernier message

  6. Quel(s) module(s) pour des alignements?

    Créée par angioedema, 11/01/2010 11h24
    • Réponses: 9
    • Affichages: 1 582
    angioedema
    12/01/2010, 14h49 Aller au dernier message

  7. bioedit et matrice d'identité

    Créée par poumy, 10/01/2010 17h26
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 111
    poumy
    10/01/2010, 18h44 Aller au dernier message

  8. Besoin d'aide pour analyser des Chip-chip data

    Créée par Osecours, 03/01/2010 12h46
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 520
    stoyak
    04/01/2010, 09h50 Aller au dernier message

  9. Blast module Bio::Tools::Run::StandAloneBlast

    Créée par Jasmine80, 21/12/2009 10h33
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 675
    Jasmine80
    21/12/2009, 10h33 Aller au dernier message

  10. recuperer la sequence d'un hit

    Créée par Bioinfoe, 30/11/2009 17h40
    • Réponses: 6
    • Affichages: 2 246
    Jasmine80
    15/12/2009, 07h49 Aller au dernier message

  11. Langage - BioInformatique

    Créée par BlueJack, 26/10/2009 20h42
    • Réponses: 10
    • Affichages: 3 480
    Jedai
    06/12/2009, 00h02 Aller au dernier message

  12. GenBank et récupération de certaines infos

    Créée par angioedema, 26/11/2009 11h07
    • Réponses: 8
    • Affichages: 1 931
    angioedema
    30/11/2009, 09h48 Aller au dernier message

  13. création d'un fichier fasta via Bio::SeqIO

    Créée par cal123, 29/11/2009 10h45
    • Réponses: 1
    • Affichages: 3 136
    cal123
    29/11/2009, 19h23 Aller au dernier message

  14. recuperation des features concernant les domaines proteiques

    Créée par fripette, 24/11/2009 13h27
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 196
    fripette
    24/11/2009, 13h27 Aller au dernier message

  15. Query coverage && Max identity

    Créée par Bioinfoe, 18/11/2009 18h27
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 818
    Bioinfoe
    23/11/2009, 20h40 Aller au dernier message

  16. Erreur Blast genbank

    Créée par Bioinfoe, 13/11/2009 21h56
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 290
    Jasmine80
    16/11/2009, 16h07 Aller au dernier message

  17. StandAloneBlast et bl2seq

    Créée par Bioinfoe, 04/11/2009 16h55
    • Réponses: 8
    • Affichages: 1 866
    Jasmine80
    10/11/2009, 13h05 Aller au dernier message

  18. Traitement fichier 2 go

    Créée par JP2mars, 13/10/2009 09h30
    • Réponses: 29
    • Affichages: 2 941
    JP2mars
    05/11/2009, 17h52 Aller au dernier message

  19. énorme fichier multi-fasta

    Créée par dev_KooK, 29/09/2009 17h59
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 305
    Beniou
    03/11/2009, 10h26 Aller au dernier message

  20. Recuperer positions start et end

    Créée par Bioinfoe, 16/10/2009 17h00
    • Réponses: 15
    • Affichages: 1 966
    djibril
    28/10/2009, 17h16 Aller au dernier message

  21. erreur code, Blast Bioperl

    Créée par Bioinfoe, 08/10/2009 20h51
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 525
    Bioinfoe
    14/10/2009, 16h59 Aller au dernier message

  22. Quels besoins pour une application bioinformatique ?

    Créée par Fango, 17/09/2009 14h10
    • Réponses: 8
    • Affichages: 2 250
    Fango
    09/10/2009, 11h52 Aller au dernier message

  23. OO problème d'écriture

    Créée par Jasmine80, 23/09/2009 12h28
    • Réponses: 8
    • Affichages: 1 284
    Jasmine80
    24/09/2009, 09h55 Aller au dernier message

  24. Sauvgarder dans PAUP

    Créée par fafou09, 20/09/2009 00h17
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 196
    MaliciaR
    21/09/2009, 09h35 Aller au dernier message

  25. bioperl : selection par features

    Créée par Zwiter, 11/09/2009 15h32
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 591
    Jasmine80
    17/09/2009, 09h35 Aller au dernier message

  26. Sondage : Création d'une application bioinformatique

    Créée par stoyak, 31/07/2009 14h11
    • Réponses: 17
    • Affichages: 3 137
    ATAKO
    16/09/2009, 15h10 Aller au dernier message

  27. problème API ensembl

    Créée par solen, 16/09/2009 11h54
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 598
    solen
    16/09/2009, 13h15 Aller au dernier message

  28. Utilisation GMOD, Chado

    Créée par jobim08, 15/09/2009 11h50
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 693
    MaliciaR
    15/09/2009, 13h18 Aller au dernier message

  29. faire du clustering hierarchique avec Bioperl

    Créée par zaboug, 07/09/2009 17h19
    2 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 3
    • Affichages: 2 378
    zaboug
    08/09/2009, 09h55 Aller au dernier message

  30. OO méthode multiple_digest de Bio::Restriction::Analysis

    Créée par Jasmine80, 02/09/2009 11h35
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 350
    Jasmine80
    02/09/2009, 15h24 Aller au dernier message

  31. OO comment utiliser une méthode interne

    Créée par Jasmine80, 28/08/2009 13h05
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 128
    Jasmine80
    02/09/2009, 08h28 Aller au dernier message

  32. GBrowse avec Perl

    Créée par jobim08, 28/08/2009 09h13
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 115
    iblis
    28/08/2009, 12h58 Aller au dernier message

  33. Probleme code lie a la bioinformatique

    Créée par micky744, 04/08/2009 11h19
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 189
    micky744
    18/08/2009, 11h32 Aller au dernier message

  34. BioMart Récupération de données

    Créée par Saoua83, 02/06/2009 10h41
    • Réponses: 3
    • Affichages: 3 385
    fripette
    18/08/2009, 08h59 Aller au dernier message

  35. convertir un fichier fasta en format EMBL via Bio::SeqIO

    Créée par zaboug, 30/07/2009 10h14
    • Réponses: 21
    • Affichages: 3 945
    zaboug
    30/07/2009, 16h17 Aller au dernier message

  36. récupérer les positions d'un motif dans un promoteur

    Créée par zaboug, 16/07/2009 15h55
    1 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 26
    • Affichages: 3 133
    zaboug
    24/07/2009, 13h42 Aller au dernier message

  37. Comparaison entre séquences et numéro d'accessions swissprot

    Créée par zaboug, 09/07/2009 14h37
    • Réponses: 30
    • Affichages: 3 567
    Jasmine80
    15/07/2009, 11h21 Aller au dernier message

  38. base de donnée - ontologie

    Créée par Saoua83, 18/05/2009 11h45
    • Réponses: 5
    • Affichages: 2 719
    Tommy31
    12/07/2009, 17h46 Aller au dernier message

  39. Récupérer une séquence à partir de ses bornes

    Créée par picopom, 01/07/2009 14h30
    • Réponses: 11
    • Affichages: 1 464
    djibril
    08/07/2009, 15h51 Aller au dernier message

  40. alignements multiples de séquences d'ADN

    Créée par Jasmine80, 18/06/2009 08h13
    • Réponses: 19
    • Affichages: 3 548
    Jasmine80
    19/06/2009, 11h18 Aller au dernier message
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