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Forum: Bioinformatique

Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.

  1. [Résolu] comparaison de fichiers SAM

    Créée par karaudrey88, 27/03/2013 10h51
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 273
    trex7g2
    29/03/2013, 12h49 Aller au dernier message

  2. regrouper et compter les séquences identiques

    Créée par Kawaccino, 20/03/2013 11h20
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 104
    Kawaccino
    20/03/2013, 14h00 Aller au dernier message

  3. nettoyage de séquence Fastq

    Créée par Kawaccino, 19/03/2013 09h42
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 360
    Kawaccino
    19/03/2013, 12h13 Aller au dernier message

  4. [Résolu] Blast via Bioperl => erreur

    Créée par Kawaccino, 12/03/2013 15h59
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 357
    Kawaccino
    13/03/2013, 11h51 Aller au dernier message

  5. aidez moi SVP

    Créée par wiiiwha, 16/02/2013 19h17
    • Réponses: 7
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    djibril
    17/02/2013, 10h12 Aller au dernier message

  6. Supprimer la redondance dans des sequences

    Créée par Isabella83, 14/12/2012 16h01
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    • Réponses: 35
    • Affichages: 3 051
    Isabella83
    05/02/2013, 12h12 Aller au dernier message

  7. Séquence complémentaire

    Créée par BOUSSEBER, 20/01/2013 20h28
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 218
    Gardyen
    21/01/2013, 16h57 Aller au dernier message

  8. Regroupement des scripts Bioinfo

    Créée par shadow19c, 10/12/2012 18h20
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 336
    stoyak
    14/12/2012, 17h04 Aller au dernier message

  9. [Résolu] erreur bioperl avec fichier FASTA

    Créée par karaudrey88, 13/12/2012 15h54
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 322
    karaudrey88
    13/12/2012, 15h54 Aller au dernier message

  10. [Résolu] recuperer les query qui n'ont sont no hits found blast

    Créée par karaudrey88, 12/12/2012 15h48
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 256
    karaudrey88
    12/12/2012, 17h47 Aller au dernier message

  11. [Résolu] recuperer le meilleur hit d'un blast

    Créée par karaudrey88, 03/12/2012 17h25
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    • Affichages: 1 141
    karaudrey88
    05/12/2012, 14h56 Aller au dernier message

  12. PALM (Phylogenetic Analysis by Maximum likelihood)

    Créée par axellePhD, 15/10/2012 17h15
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    axellePhD
    15/10/2012, 17h15 Aller au dernier message

  13. retrouver seq nucleotide dans fichier initial apres tblastn local

    Créée par nogaro, 07/09/2012 16h06
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 160
    nogaro
    07/09/2012, 16h06 Aller au dernier message

  14. critéres de comparaison entre algorithmes d'alignement multiple

    Créée par anoir19, 05/09/2012 19h00
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 166
    anoir19
    05/09/2012, 19h00 Aller au dernier message

  15. un problème académique

    Créée par anoir19, 27/08/2012 01h08
    • Réponses: 3
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    stoyak
    28/08/2012, 11h03 Aller au dernier message

  16. synthese de données

    Créée par karaudrey88, 24/07/2012 15h37
    • Réponses: 14
    • Affichages: 1 143
    karaudrey88
    02/08/2012, 16h56 Aller au dernier message

  17. [Résolu] BatchPrimer3 : input problem

    Créée par angioedema, 31/07/2012 17h34
    • Réponses: 1
    • Affichages: 984
    angioedema
    01/08/2012, 16h25 Aller au dernier message

  18. Bioinformatique avec diplome STI2D possible ?

    Créée par MrChronosDeath, 20/07/2012 03h15
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    Gardyen
    20/07/2012, 11h16 Aller au dernier message

  19. Exporter un fasta et/ou GFF3 de Gbrowse vers Galaxy

    Créée par angioedema, 20/06/2012 17h20
    • Réponses: 0
    • Affichages: 981
    angioedema
    20/06/2012, 17h20 Aller au dernier message

  20. Extraire une sous-séquence d'un fasta

    Créée par pontarose, 13/06/2012 15h36
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 255
    Quantactique
    20/06/2012, 03h43 Aller au dernier message

  21. Liaison Galaxy - Gbrowse récupération du fichier GFF3 ?

    Créée par angioedema, 14/06/2012 14h30
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 039
    angioedema
    14/06/2012, 14h30 Aller au dernier message

  22. [Résolu] Gbrowse Galaxy et Perl

    Créée par angioedema, 13/06/2012 15h44
    • Réponses: 8
    • Affichages: 1 254
    angioedema
    14/06/2012, 10h38 Aller au dernier message

  23. BioPerl et Primer3

    Créée par maniabrahim, 23/05/2012 12h03
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 283
    Jasmine80
    01/06/2012, 10h30 Aller au dernier message

  24. comment créer une population prédéfinie

    Créée par anoir19, 25/05/2012 19h34
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 022
    anoir19
    25/05/2012, 19h34 Aller au dernier message

  25. j'ai besoin d'une base de donnée des séquence ADN avec exetension TFA

    Créée par anoir19, 17/05/2012 23h42
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 141
    anoir19
    18/05/2012, 00h07 Aller au dernier message

  26. [Résolu] aide pour base de donnée des séquences ADn

    Créée par anoir19, 16/05/2012 19h29
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 002
    anoir19
    16/05/2012, 19h29 Aller au dernier message

  27. Besoin d'aide SVP

    Créée par menoulette, 15/05/2012 10h59
    • Réponses: 0
    • Affichages: 975
    menoulette
    15/05/2012, 10h59 Aller au dernier message

  28. Paramétrage de Bio::Tools::Run::RemoteBlast

    Créée par mathgon, 11/05/2012 17h26
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 015
    Gardyen
    14/05/2012, 10h35 Aller au dernier message

  29. l'outil Panseq pour la comparaison de genomes

    Créée par hajarita, 04/05/2012 11h18
    • Réponses: 0
    • Affichages: 955
    hajarita
    04/05/2012, 11h18 Aller au dernier message

  30. [Résolu] Lecture de fichier en BioPerl

    Créée par Quantactique, 25/04/2012 17h20
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 145
    Quantactique
    02/05/2012, 18h02 Aller au dernier message

  31. Ajouter des lignes dans un fichier GenBank

    Créée par hajarita, 15/04/2012 23h52
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 111
    Quantactique
    25/04/2012, 12h49 Aller au dernier message

  32. Traitement Fichiers GenBank

    Créée par Quantactique, 25/04/2012 11h28
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 004
    Quantactique
    25/04/2012, 11h28 Aller au dernier message

  33. add organism BLAST

    Créée par mycaweb, 23/04/2012 22h07
    • Réponses: 1
    • Affichages: 966
    Gardyen
    24/04/2012, 18h52 Aller au dernier message

  34. [Résolu] Traiter un fichier EMBL

    Créée par Quantactique, 23/04/2012 17h28
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 079
    hajarita
    23/04/2012, 18h52 Aller au dernier message

  35. [Résolu] Integration de R dans perl

    Créée par karaudrey88, 19/03/2012 11h17
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 050
    mathgon
    20/03/2012, 15h19 Aller au dernier message

  36. [Résolu] tests statistiques et p.value

    Créée par karaudrey88, 16/03/2012 15h52
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 193
    karaudrey88
    19/03/2012, 11h02 Aller au dernier message

  37. [Résolu] lancer une commande R dans perl

    Créée par karaudrey88, 16/03/2012 15h09
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 358
    karaudrey88
    19/03/2012, 10h56 Aller au dernier message

  38. Résultat de simulation des réseaux génique de Thaliana en appliquant du stress salin

    Créée par BambinaO, 16/03/2012 11h19
    • Réponses: 1
    • Affichages: 965
    stoyak
    18/03/2012, 17h40 Aller au dernier message

  39. Analyse des données puces affymetrix

    Créée par simsimabioinfo, 10/03/2012 00h58
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 227
    stoyak
    18/03/2012, 17h37 Aller au dernier message

  40. Interprétation et Modélisation des réseaux génique

    Créée par BambinaO, 10/03/2012 12h57
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 064
    angioedema
    14/03/2012, 16h14 Aller au dernier message
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