Discussion :

[parp1]

Bonjour, voila je developpe un activeX sous VB pour la visualisation de dosimetrie 3D avec vtk.

Ce que je souhaite faire, une chose tres basique en imagerie médicale, c'est appliquer une LUT(voir titre pour les néophites).

Pour cela, je souhaite integrer les LUTs d'imageJ disponible dans ImageJ/luts/.

Alors voila je me pose deux question.

Le format .lut est t'il standardisé?

Comment est-t-il structuré dans ce cas?

J'ai bien essayer de l'ouvrir avec note pas mais ca serait bien du binaire.

Pour que je puisse l'exploiter il me faut sa structure....

Merci a vous, vous etes bien aimables.....

[souviron34]

je ne sais pas du tout, trop longtemps que j'ai quitté le domaine..

Mais 1 idée simple :

Le standard DICOM ne définit pas des LUT ?

[parp1]

Merci souviron. Mais je suis chez un 'fabriquant' et nous obtenons des image issues de notre camera, cet format est un format brut en niveau de gris.

Tous le color et rendu 3D c'est moi qui m'en occupe. Jusqu'ici j'arrive a en créer un moi meme, mais j'aimerai plus qu'on puisse en lire une "standardisé" afin que la manip ne soit pas manuel.

En gros qu'on est a aller chercher notre LUT dans un menu (comme imageJ)

Bon apres un petit calcul tous bete.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
le fichier fait 768 octets
sachant qu'une LUT contient 256 couleurs en général
Ca nous fait 3 composantes par couleurs.

Donc le fichier doit etre structuré de cette facon.


rgb
rgb
rgb
rgb
ou peut etre est ce ?

bgr
bgr
bgr
bgr
....

Je fait des tests et je vous tiens au courant.

[souviron34]

mais je réitère...

Je pense que les LUT sont spécialisées pour tel ou tel aspect et technologie (c'était le cas en RMN, et je pense que ça doit lêtre aussi en dosimétrie).

Il me semble que ImageJ te donnera des LUT de traitement d'images, mais pas de traitements d'images médicales spécialisé dosimétrie. Tu n'as pas droit à tous les contrastes, par exemple, ni tous les types de paliers.

Et je pense que DICOM (ou le sous-groupe spécialisé dosimétrie d'ACR NEMA) à dû définir les standards de LUT applicables.

pour voir telle ou telle pathologie ou spécificité.

[EDIT]

Quant au fichier, ça pourrait être tout d'un bloc, ou tout r tout b, tout g, ....
A ce niveau-là c'est du tatonnement..

[/EDIT]

[parp1]

Ce ce que je vais faire tatonner... En fait le truc c'est que notre outils permet de simuler une radiotherapie avec imrt ou standard.

Nous obtenons des images, je créer ce volume.

Ensuite je créer la LUT en interne, mais je veux avoir une base pour ne pas m'embeter a definir les LUT points par points.

C'est la que je pense que les LUTs sont standardisées.

Royal,sépia,24colors.... Donc apres c'est a moi de m'adapter.

Je crois que maintenant le format DICOM en dose est DICOM RT, mais pas sur du tout.

Merci a toi de ton attention.

[pseudocode]

Ce qui est bien avec l'open-source... c'est que les sources sont open

Donc, apres une lecture en diagonale du code ImageJ, il y a 3 formats de LUT.

Raw: 768 octets = 256 octets composante R, suivis de 256 octets composante G, suivis de 256 octets composante B

!Raw: idem Raw, avec une entete de 32 octets (NIH Image LUT Header)

Text: je sais pas trop... visiblement une image en format texte

[souviron34]

Raw: 768 octets = 256 octets composante R, suivis de 256 octets composante G, suivis de 256 octets composante B

tu vois, j'étais pas loin

[ToTo13]

Bonjour,

je ne connais pas les standarts, mais je connais quelques spécialistes du domaines : Edouard Thiel et Eric Remy.

- Si tu regardes sur le site d'Edouard Thiel, tu trouvera des fonctions C qui calculent des LUT avec distances de Chamfrein ou distance Euclidienne.
- Si tu lis la thèse d'Eric Remy il y a tout ce qu'il faut pour calculer une LUT. Sa version de l'axe médian est même la seule qui totalement stable sur le sujet.

Bonne continuation...