Discussion :

[Invité]

Bonjour,

Je tente d'accélérer l'exécution de mon code en le convertissant en Cython.

Or, j'obtiens un message d'erreur dans le terminal au moment de convertir mon fichier pyx
en l'occurence ceci:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

error: unknown file type '' (from 'progprincipal')

S'agit-il d'une difficulté liée à mes déclarations de string vide du genre x ='' ?

Quelqu'un aurait une idée ?
Merci à tous.

[Sve@r]

Bonjour

Quelqu'un aurait une idée ?

Sans un code minimaliste reproduisant le souci, difficile à dire. Cela pourrait effectivement provenir de tes strings vides, si par exemple ton code était copié+collé depuis un tutoriel type pdf dans lequel les caractère "quote simple" ne serait pas représenté par un ' classique mais par un caractère un peu plus "habillé" mais qui n'est pas un caractère reconnu par Python...

[Invité]

Bonsoir.

Merci pour la réponse.

Mon code n'est pas un copier-coller. Il s'agit de mon programme perso que je mène depuis un moment.
Donc il n'y a pas d'erreur se rapportant à ce type de manipulation.

En fait, le fichier que je nomme 'progprincipal' fait plus d'une ligne (20 000) alors difficile, selon moi, d'identifier d'où vient le soucis
car le retour d'erreur ne me livre pas plus d'information que ce que je vous ai indiquée.

Ce qui me paraissait étonnant, si cette hypothèse se révèle juste, c'est que Cython formerait une erreur se rapportant à la désignation d'un variable qui, sous python, peut valablement être faite sous la forme:

x =""

L'erreur vient nécessairement de l'homme donc je n'arrive pas identifier où je me plante. Il y a quelque chose qui m'échappe.

La nuit porte conseille ... ou la communauté !

[wiztricks]

En fait, le fichier que je nomme 'progprincipal' fait plus d'une ligne (20 000) alors difficile, selon moi, d'identifier d'où vient le soucis
car le retour d'erreur ne me livre pas plus d'information que ce que je vous ai indiquée.

Quand on ne sait pas d'où vient l'erreur, on peut essayer de mettre des lignes en commentaire pour voir si elle est toujours là. Et faire une sorte de recherche dichotomique pour la cerner plus précisément.
Mais c'est pour les cas désespérés.

De toutes façons, sans code pour reproduire, les idées sont à chercher dans les articles glanés sur le Web qui parlent de problème similaire. C'est aussi laborieux mais ça permet de mieux saisir les composants qui sont concernés et peut être donner des idées sur quoi chercher.

- W

[tyrtamos]

Bonjour

Avec aussi peu d'infos, il est difficile de trouver une solution.

En cherchant sur le web avec "cython error: unknown file type ''", on trouve des sites qui parlent de l'erreur mais le plus souvent avec " type '.pyx' ". Cela suggère que l'erreur n'est pas forcément dans le code, mais peut se trouver aussi dans le processus de traitement par cython. Processus dont on ne connait rien pour l'instant: quel méthode a été utilisée? L'erreur peut aussi se trouver dans l'installation elle-même à cause d'un problème de version.

Quant à gagner du temps d'exécution avec la compilation par cython, attention à un détail: on gagne vraiment du temps lorsque le type des variables python passées au code C ou C++, existe en C ou C++! Sinon, le code compilé devra appeler l'API Python souvent, et le gain de temps ne sera pas présent, et même pourra être moins bon qu'avec le Python pur (ça m'est déjà arrivé).

[jurassic pork]

hello,
peux-tu nous montrer la commande ou le script python que tu utilises pour "Cythoniser" ton fichier progprincipal ?
exemple de commande :

cythonize -b -i progprincipal.pyx

exemple de script :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
from setuptools import setup
from Cython.Build import cythonize
 
 
setup(
    ext_modules=cythonize("progprincipal.pyx"),
)

puis lancer :

python setup_progprincipal.py build_ext --inplace

houla ! 20000 lignes de code dans un seul fichier : cython risque d'avoir du mal à le digérer. La vocation de cython c'est plutôt d'optimiser des bouts de code dont l'exécution est lente en python. Il aurait été plus sage de découper ton programme en plusieurs morceaux et de ne compiler en cython que les parties lentes. Est-ce qu'il y a des boucles importantes ou des calculs dans ton programme ?


Dans ce graphique on voit que cython est intéressant surtout pour les boucles et les calculs.

Benchmark pour les 4 tests, relativement au temps d'exécution par Python. De gauche à droite : print "Bonjour", lecture de gros fichier, opérations mathématiques en boucle, alignement de séquences. En bleu : Python ; en vert : compilation avec Cython seul sans typage ; en orange : avec spécification des types des variables.

Ami calmant, J.P