Discussion :

[elvolcano]

J'ai un réel problème avec les données manquantes.
Je pars d'un fichier csv que j'importe dans R.

Une fois le fichier csv importé dans R, pour certaines variables les données manquantes apparaissent bien en "NA" et pour d'autres variables les données manquantes apparaissent comme ça : ""

D'autres part, quand je transforme une variables de 'numeric' à 'as.factor', une donnée manquante en "NA" se transforme en "".

Est-ce que vous pouvez m'éclairer? et comment changer ces "" en "NA"

Merci bien.

[pitipoisson]

Bonjour,

Comme toujours, quelques lignes incriminées du csv + les lignes de code pour l'importer sont nécessaire pour répondre à ta question.

[elvolcano]

Code :

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n	jour_pl	pcpn	nbheure	scanner	pcr	entourage
25	2	5	0	0	0	0
26	2		0	0		1
31	5	34		1	1	
32		20	0		0	0
23	6	15		0	0	0

Code :

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mening <-  read.csv2("C:/Documents and Settings/stagiaire/Bureau/Meningite3.csv",header=TRUE)

Code :

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mening$jour_pl <- factor(mening$jour_pl, exclude = NULL)
mening$pcpn <- as.numeric(mening$pcpn)
mening$nbheure <- as.numeric(as.character(mening$nbheure))
mening$scanner <- factor(mening$scanner, exclude = NULL)
mening$pcr<- factor(mening$pcr, exclude = NULL)
mening$entourage <- factor(mening$entourage, exclude = NULL)

Avec ces codes j'arrive à m'en sortir un peu.
les données manquantes ne sont pas affichées en "NA" dans la table mais en "".
Cependant elles sont bien considérées comme des données manquantes, même si elles sont comptabilisées en suite dans mes graphiques ou elles apparaissent comme une entité.

comment faire en sorte qu'elles soient bien considérées complétement manquantes y compris quand j'affiche la table et qu'elles apparaissent bien en "NA"?

[dickoa]

L'idéal c'est de savoir comment sont codées les valeurs manquantes dans le fichier de base avant d'importer...le plus important sera dans ton cas l'option
"na.string". Pour être plus claire : si par exemple elles sont codées ".."

Code :

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meninge <- read.csv2("...../meningite.csv",header=TRUE,na.strings="..")

donc regarde dans ton fichier et tu pourra remplacer ".." par ce qu'il y'a

autre option interessante lors de l'importation : c'est colClasses. Je te conseille de de faire un ?read.table