Bonjour,

Je me demandais si vous seriez intéressés par la réalisation d'une application graphique faite en Perl/Tk qui permettrait d'effectuer des tâches répétitives en bioinformatique. Elle serait gratuite, installable sous Windows (et pourquoi pas sous Linux). Elle pourrait permettre de faire ceci :
Traduire une séquence d'ADN en séquence protéique (les 6 cadres de lecture)
Fusionner ou découper des fichiers fasta
Convertir un fichier fasta en embl
Trouver un motif dans une séquence fasta
Parser un fichier Genbank (récupérer la séquence, les positions d'exons, introns, etc)
Parser un fichier de résultat blast
.../...

Si oui, il faudrait que tout le monde propose des idées de fonctions à ajouter.
Que l'on fasse ensuite un mixage des propositions, que ceux qui le souhaitent proposent un ou plusieurs codes réalisant des tâches précises.

Je me chargerais en plus de certaines tâches, de concevoir l'application graphique en combinant tous vos codes.

Intérêt : Le but est que chacun puisse avoir un outil bioinfo basique en local sans être dépendant du net.

N'hésitez pas à me dire ce que vous en pensez, à faire des propositions, des suggestions que vous soyez pour ou contre.

Merci