Discussion :

[yann_m]

Bonjour,

je rencontre un léger problème de synthaxe commune entre les commandes de mon script et d'un logiciel, je m'explique, j'utilise un petit logiciel (Rasmol), qui permet de modéliser un fichier de donné de format texte en une image. Je dois pour ma part convertir des centaines de ces fichiers texte pour réaliser une animation. J'ai donc écrit un script qui fait la chose suivante :

1- Ouvrir la premier fichier texte avec le logiciel (Rasmol)
2- enregistrer l'image
3- Quitter le logiciel
4- revenir à l'étape 1 en incrémentant le fichier à convertir

en 3) la commande permettant de quitter le logiciel est exit, lorsque le script arrive à cette instruction il s'arrête, d'où mon problème puisque uniquement un des fichiers a été convertit

Je joins mon script, si quelqu'un a une idée, je lui en sais reconnaissant,
merci, cordialement,
Yann.

Code :

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 #!/bin/bash
# Script de convertion de fichier pdb en jpg via rasmol
 
echo ---- Convertion des images sur : $USER -----
 
numpdb=10000
numjpg=0
 
#test -e /home/yann/Travail/Code_Fortran/Monte_Carlo/Code/config1/config_fcc10500.pdb    
while [ $? -eq 0 ] ; 
do 
 
rasmol config_fcc$numpdb.pdb << END
 
chaine=(
spacefill
refresh
save ppm $numpdb.ppm 
exit
)
 
exec(chaine)
 
echo Sortie de rasmol
 
test -e /home/yann/Travail/Code_Fortran/Monte_Carlo/Code/config1/config_fcc10500.pdb
done
exit

[Sve@r]

Elle est où la chaîne "END" indiquant où s'arrête l'input de "rasmon_config" ???

[yann_m]

Oui, c'est en effet ce dont je viens de me rendre compte. J'avais bien compris que la synthaxe rasmol mon_fichier << END permettait de donner les instructions au logiciel même sans bien savoir comment en sortir...

Merci beaucoup,
Salut.