Discussion :

[abdou3058]

bonsoir tous le monde
est ce qu'il ya un moyen d'executer un script R contenu dans un fichier.R
sans recourir la fonction source , parexemple comme en perl on execute directement le fichier , sachant que je travaille sous le systeme windows
j'ai entendu parlé de shebang !#/usr/bin/Rscript mais je comprend pas trop
merci d'avance
bonne soirée

[A. D.]

Bonjour,

Je ne suis pas sûre d'avoir bien compris ce que vous souhaitez faire, mais vous pouvez par exemple essayer de taper ceci dans une invite de commande Windows :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

R CMD BATCH "monscript.R"

Pour que cela fonctionne, il faut notamment que le chemin vers votre install de R soit bien renseigné dans le PATH.

HTH !


Cordialement,


A.D.

[abdou3058]

bonsoir
merci de m'avoir repondu
en faite je viens d'essayer la commande mais ca marche pas ca me dit R n'est pas reconnu comme une commande interne , mais le chemin je l'indique ou dans le script ou dans la l'invite de commande ??
merci

[dev_ggy]

Bonjour,

J'ajouterais qu'il existe aussi la fonction RScript pour exécuter des scripts.

Concernant l'erreur il faut ajouter R dans le PATH.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

export PATH=/usr/bin/Rscript

ou

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

export PATH=/usr/bin/R

Tu choisie les commandes que tu souhaites avoir.

Normalement l'ensemble des versions de linux intègrent les fonctions de /usr/bin. C'est curieux qu'il n'y soit pas dans le tiens.

Au plaisir de te lire.

[abdou3058]

bonjour;
moi je travaille sous windows pas sur lynux c'est ca le probleme , et le fichier Rscript je le trouve pas avec mon installation R , desoler parceque je suis débutant et je connais pas trop dans ce domaine , je vais essayer quand meme la commande que tu m'as donné mais j'imagine que je dois changer le chemin parceque sous windows R n'est pas dans le meme endroit
merci de l'information
bonne journée

[dev_ggy]

Excuse-moi, j'ai mal lu ton premier message.

A.D. a entièrement raison.

Concernant ma remarque sur le PATH, elle est aussi valable sous Windows, mais la direction qui devrait ressembler plutôt à cela C:\Program Files\R\R-3.3.0\bin. Selon les versions de Windows, la direction peut être différente, c'est pour cette raison que je mets au conditionnel. La procédure sous Windows pour modifier le path, je ne la maîtrise pas. Mais dans ce répertoire noté au-dessus, tu as deux fichiers qui t'intéressent Rscript.exe et R.exe.

Au plaisir de te lire.

[mgdondon]

Bonjour,

J'ai trouvé cette page qui explique comment définir la variable path en fonction du système d'exploitation.

Cordialement,

[abdou3058]

bonjour ;
desoler de vous déranger mais ca marche toujours pas ;
voila le code que j'ai fait

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/Program Files/R/R-3.3.1/bin/Rscript
 
i<-0
 
while (i<10){ 
 
print(i)
 
i<-i+1  
 
} 
 
print("on sort de la boucle")
print ("on est arrive")

parce que Rscript.exe je l'ai trouvé ds le disque C:programme file
et voilà la commande que j'ai tapé sur l'invite de commande

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

R CMD BATCH "Bibliothèques/Documents/fichier.R

MERCI

[mgdondon]

La log est envoyée dans un fichier .Rout lors de l'exécution en batch.

Vous pouvez aussi sélectionner les résultats à exporter. Par exemple, vous pouvez mettre la ligne suivante dans un script monscript.R :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

write.csv(1:10,"D:test.csv")

puis exécuter

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

R CMD BATCH "monscript.R"

comme indiqué par A.D.

Cordialement,