Discussion :

[Sleumb]

Bonjour à tous,

Je souhaite représenter graphiquement l'évolution d'un score en fonction du temps depuis le diagnostic (une courbe du score moyen pour tous les sujets en fonction du temps avec son intervalle de confiance) et y superposer les scores d'un patient particulier pour chacune de ses visites. Je ne sais pas trop comment m'y prendre

Je dispose des variables suivantes en colonnes : ID du patient, Date du diagnostic, Date de la visite, score du test

Les dates de visite sont aléatoires (chaque fois que le patient se rend chez le clinicien) et, pour chaque visite, le score du test est renseigné.

Si quelqu'un a une idée, je suis preneur.

Merci beaucoup

[VonVelten]

Bonjour,


pour cela, je conseille d'utiliser le package ggplot2, et notamment sa fonction geom_smooth.

Un petit exemple de code qui marche :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#Je crée mon jeu de données simulés pour l'exemple
ID<-as.factor(rep(c("1","2","3","4"),times=30))
Diago<-as.Date(rep(c("2012-07-21","2011-06-12","2012-06-21","2014-05-09"),times=30),format="%Y-%m-%d")
Test<-as.Date(rep(c("2012-07-29","2011-06-10","2012-07-24","2013-08-10"),each=30),format="%Y-%m-%d")
score<-sample(1:10,120,replace=T)
data<-cbind(as.data.frame(ID),Diago,Test,score)
#je récupère l'individu dont je veux afficher les points
sub<-data[data$ID=="3",]
 
 
library(ggplot2)
p<-ggplot(NULL)+geom_smooth(data=data,aes(x=Test,y=score,group=ID,colour=ID))
p<-p+geom_point(data=sub,aes(x=Test,y=score,colour=ID))
p

Voila ce que la donne :



Ca ne ressemble pas à grand chose car le jeu de données ne vaut rien, mais pour montrer l'idée globale.

La couleur des intervalles de confiance dépend du nombre qui se recoupent, il est donc normal que cela soit très grisé autour du centre où les courbes se rejoignent. En théorie, il y a une zone de confiance autour de chaque courbe, mais ce n'est pas visible ici. Je vous conseille de faire un essai avec vos données.


En espérant que cela réponde à la question

[Sleumb]

C'est splendide, merci beaucoup pour votre réponse.
J'essaye sur mon jeu de donnée sous peu et je vous ferai un retour.

Encore une fois merci.