Discussion :

[Fnouch]

Bonjour à tous,

je viens de faire plot qui ne me conviens pas tout à fait. Il s'agit d'un cumul d'ejection de champignon en fonction de différentes années. Le voici :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

xyplot(cumEject ~ as.factor(Annee), data=res)

mon but serait plutôt d'avoir ce graphe mais que l'axe des abscisses soit les différents mois de l'année (une des variables de mon jeu de données, et d'avoir des courbes pour chaque années

Je pense que je dois utiliser la fonction panel dans lattice mais je ne sais pas comment faire;..

Si vous avez une idée ou une quelconque suggestion je suis preneuse !

Merci

[Fnouch]

En faisant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

xyplot(cumEject ~ Mois|Annee, data=res.fusa)

j'arrive à obtenir :




mais c'est quasiment illisible ... j'aurai aimé des courbes, toutes présentes sur le même graphique

[arm3366]

Bonjour,
Avez-vous essayez la fonction boxplot()

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

boxplot(cumEject ~ mois)

[Fnouch]

Oui mais dans ce cas ça prends en compte toutes les années à la fois (et je n'ai toujours pas de belle courbe)

[arm3366]

C'est difficile d'y voir plus claire si on ne sait pas à quoi ressemble les données que vous utilisez.Est ce que vous pouvez poster les résultats des commandes suivantes:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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str(MesDonnees)
head(MesDonnees)

[Fnouch]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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 CasType StationLocale   Variete Semis.date  Date Jour Mois Annee TMin TMax  TMoy Pluie indexIno cumIno tauxEject inoEject cumEject tauxGermi sporesGermes
1       1          2753 TOISONDOR 27/10/2006 39091    9    1  2007 11.0 14.1 12.55   0.1        0      0         1        0        0 0.9999919            0
2       1          2753 TOISONDOR 27/10/2006 39092   10    1  2007  7.0 11.0  9.00   1.7        0      0         1        0        0 0.9999218            0
3       1          2753 TOISONDOR 27/10/2006 39093   11    1  2007  2.0 12.4  7.20   0.1        0      0         1        0        0 0.9788879            0
4       1          2753 TOISONDOR 27/10/2006 39094   12    1  2007  6.0 11.8  8.90   0.2        0      0         1        0        0 0.9992375            0
5       1          2753 TOISONDOR 27/10/2006 39095   13    1  2007 10.0 12.2 11.10   0.5        0      0         1        0        0 0.9999610            0
6       1          2753 TOISONDOR 27/10/2006 39096   14    1  2007  1.9 10.6  6.25   0.0        0      0         1        0        0 0.9893133            0
  cumGermes      Date2
1         0 2012-01-09
2         0 2012-01-10
3         0 2012-01-11
4         0 2012-01-12
5         0 2012-01-13
6         0 2012-01-14

et :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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'data.frame':   108286 obs. of  21 variables:
 $ CasType      : num  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ StationLocale: int  2753 2753 2753 2753 2753 2753 2753 2753 2753 2753 ...
 $ Variete      : Factor w/ 128 levels "ACALOU","AEROBIC",..: 125 125 125 125 125 125 125 125 125 125 ...
 $ Semis.date   : Factor w/ 273 levels "01/10/2007","01/10/2008",..: 229 229 229 229 229 229 229 229 229 229 ...
 $ Date         : num  39091 39092 39093 39094 39095 ...
 $ Jour         : num  9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 ...
 $ Mois         : num  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ Annee        : num  2007 2007 2007 2007 2007 ...
 $ TMin         : num  11 7 2 6 10 1.9 -3.1 7 8 10.5 ...
 $ TMax         : num  14.1 11 12.4 11.8 12.2 10.6 7 10.6 13.6 14.2 ...
 $ TMoy         : num  12.6 9 7.2 8.9 11.1 ...
 $ Pluie        : num  0.1 1.7 0.1 0.2 0.5 0 0 0.8 12.9 1.1 ...
 $ indexIno     : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ cumIno       : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ tauxEject    : num  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ inoEject     : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ cumEject     : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ tauxGermi    : num  1 1 0.979 0.999 1 ...
 $ sporesGermes : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ cumGermes    : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Date2        : Date, format: "2012-01-09" "2012-01-10" "2012-01-11" "2012-01-12" ...

[arm3366]

Bonjour,
Le souci était que la variable "mois" est considérée par R comme étant numérique, alors que pour une boxplot la variable sur l'axe des abscisses doit être catégorielle (factor ou character).
Essayez ce bout de code, pour voir si cela correspondra à vos besoins:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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3
boxplot(cumEject ~ as.factor(mois))
#ou 
boxplot(cumEject ~ as.character(mois))

[Christophe Genolini]

Bonjour
Travailles-tu avec des données longitudinales (c'est à dire des mesures répétées, ou encore plusieurs mesures pour un même individu) ?
Christophe

[Fnouch]

Non, 1 individu = 1 réponse et tous les individus sont indépendants