Discussion :

[Momoze]

Bonjour, à tous
je voudrais remplir un diagramme de venn à l'aide de ma base de données
je veux faire une requête d'intersection
je signale que j'utilise open office base j'ai 3 tables et que j'utilise le module requête en mode SQL
voici donc ma requête qui m'est indiquée comme erreur

Code :

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select a.Name, a.logFC from blessvsref as a where a.Name like 'LOC_%' and a.logFC > 1
intersect
select b.Name, b.logFC from infvsref as b where b.Name like 'LOC_%' and b.logFC >1

m'affiche un beau message d'erreur

Code :

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syntax error
Statut SQL: HY000
Code d'erreur: 1000
 
syntax error, unexpected $end, expecting BETWEEN or IN or SQL_TOKEN_LIKE

voila quelqu'un a une idée de la provenance de l'erreur ?
merci d'avance pour votre aide et vos conseils

[CinePhil]

Dommage, le message d'erreur ne dit pas où se situe l'erreur !

Si c'est INTERSECT qui n'est pas supporté, ça peut peut-être se remplacer par une jointure ?
Y a t-il une correspondance possible entre les deux tables ?

[Momoze]

non, pas de correspondance possible a part justement les noms communs que j'éssaie de récupérer justement

mais chaque table possède une colonne id, avec un numéro qui leur est propre, tu pense que je peux faire la jointure sur ces données ?
si oui, comment ma requête devrait être formulée stp.

[SQLpro]

INTERSECT est une forme de jointure !

Code :

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SELECT a.Name, a.logFC 
FROM   blessvsref AS a 
       INNER JOIN infvsref AS b
             ON a.Name = b.Name AND  a.logFC = b.logFC
WHERE  a.Name LIKE 'LOC_%' AND a.logFC > 1
  AND  b.Name LIKE 'LOC_%' AND b.logFC >1

A +

[CinePhil]

Tu peux nous donner la description des deux tables et un petit jeu de données ainsi que le résultat attendu pour qu'on comprenne mieux ce que tu veux faire ?

[Momoze]

alors chaque table est structurée de la même façon :

Code :

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idkey (cléprim) | Name | sequence | id | Dbname | pvalue | logfc
1                    |rrymv  |  atgcaa...|  2 | dbretro2 |0.006   | 1.85    
2                    |  LOCos | tggaccg..|28  |dbretro26| 0.048  | -1.89
3                    | rire3    |aaaaccc..|   85|dbretro68|0.025   |2.45
...

les deux tables représentent 2 conditions d'expériences, et il faut que je trouve les noms communs (Name) dans les deux condtions avec comme restrictions pour chaque condition telle que :
Name : uniquement ceux commençant par LOCos et
pvalue : uniquement celles supérieures a 1

[CinePhil]

il faut que je trouve les noms communs (Name) dans les deux condtions avec comme restrictions pour chaque condition telle que :
Name : uniquement ceux commençant par LOCos et
pvalue : uniquement celles supérieures a 1

Alors tu peux faire une jointure sur le Name :

Code :

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SELECT b.Name, b.logFC
FROM blessvsref b
INNER JOIN infvsref i ON b.Name = i.Name
WHERE b.Name LIKE 'LOCos%'
  AND b.pvalue > 1
  AND i.pvalue > 1

pvalue : uniquement celles supérieures a 1

Dans ta requête, tu mettais logfc > 1 !