Discussion :

[filou2931]

Bonjour à tous,

Je suis confronté à un problème de compilation ou link sous Matlab.

Tout d'abord, pour introduire un peu mon soucis, voici quelques explications :

• j'ai un fichier fortran 'algo.f' dans lequel j'ai une subroutine TOTO. Cette subroutine fait appel à différentes fonctions que l'on retrouve dans ce même fichier.

• l'objectif est d'intégrer ce code fortran dans un modèle Simulink, pour au final générer une S-Fonction de ce modèle via RTW de Matlab

Après quelques tâtonnements, j'ai compris que pour générer une S-Fonction sous RTW, il faut lui donner du code C : RTW n'accepte pas directement du Fortran, il faut donc créer un fichier C 'interface.c' dans lequel il faut définir les fonctions "d'interfaçage" entre Simulink et Fortran (avec par exemple la fonction mdlOutput...). On parle aussi de S-Fonction "inline".

Je dispose maintenant de 2 fichiers : 'algo.f' et 'interface.c' ; il ne reste plus qu'à les compiler et les linker pour obtenir ma dll que j'intégrerai ensuite dans mon modèle Simulink.
Cette complation s'effectue en 2 étapes :

• création du fichier 'algo.obj' à partir du fichier Fortran. J'utilise la commande mex avec le compilateur fortran Intel Visual studio Fortran 10.1.

• création de la dll à partir du fichier C et du fichier 'algo.obj'. J'utilise également la commande mex avec le compilateur C de base sous Matlab : lcc.

Pour faciliter la compilation, je commence avec une subroutine fortran vide ou avec un algo très simple du style sorties=entrees. De cette manière, tout est ok : création des objets, link de ces objets et création de la dll, puis enfin génération de la S-Fonction finale sous RTW incluant cette dll et le reste du modèle.

Après ce succès, je décide de mettre les algo voulus dans mon code Fortran : la compilation du code fortran se déroule bien, l'objet 'algo.obj' est créé sans soucis.
Le problème intervient lors de la seconde compilation, et à mon avis lors du link... Puisque j'ai comme infos des messages du type "algo.obj .text: undefined reference to '_expf'", ce qui me laisse penser qu'il manque une ou plusieurs librairies à passer au linker. Ce besoin de ces librairies étant directement aux fonctions appelées dans mon algo Fortran.
Dès lors, je rajoute diverses librairies mais derrière c'est l'effet cascade : pour une "undefined refrence" de résolue j'en récupère 10...

Bref tout ça pour en arriver à ma question : comment configurer mon linker, ou comment utiliser la fonction mex pour compiler correctement et surtout linker mes objets ensemble ?

Ci-dessous un aperçu de ce que Matlab me renvoie lors de ces compilations, avec l'option -v de la commande mex pour voir les options de compilation et de link :

• Ici la première compilation
  

  >> mex -v -f mexopts_fortran.bat -c algo.f
  This is mex, Copyright 1984-2007 The MathWorks, Inc.
  
  -> Options file specified on command line
  ----------------------------------------------------------------
  -> Options file = mexopts_fortran.bat
  MATLAB = C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a
  -> COMPILER = ifort
  -> Compiler flags:
  COMPFLAGS = /fpp /Qprec "/IC:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a/extern/include" -c -nologo -DMATLAB_MEX_FILE /fixed
  OPTIMFLAGS = /MD -Ox -DNDEBUG
  DEBUGFLAGS = /MD -Zi /PDB:"algo.mexw32.pdb"
  arguments =
  Name switch = /Fo
  -> Pre-linking commands =
  -> LINKER = link
  -> Link directives:
  LINKFLAGS = /DLL /EXPORT:MEXFUNCTION /MAP /LIBPATH:"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\extern\lib\win32\microsoft" libmx.lib libmex.lib libmat.lib /implib:C:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_uZE9e1\templib.lib /NOLOGO
  LINKDEBUGFLAGS = /debug /PDB:"algo.mexw32.pdb"
  LINKFLAGSPOST =
  Name directive = "/out:algo.mexw32"
  File link directive =
  Lib. link directive =
  Rsp file indicator = @
  -> Resource Compiler = rc /fo "mexversion.res"
  -> Resource Linker =
  ----------------------------------------------------------------
  
  
  --> ifort /fpp /Qprec "/IC:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a/extern/include" -c -nologo -DMATLAB_MEX_FILE /fixed /Foalgo.obj /MD -Ox -DNDEBUG -DMX_COMPAT_32 "X:\algo.f"
  
  >>

• Ici la seconde compilation
  

  >> mex -v -f mexopts_lcc.bat interface.c algo.obj
  This is mex, Copyright 1984-2007 The MathWorks, Inc.
  
  -> Options file specified on command line
  ----------------------------------------------------------------
  -> Options file = mexopts_lcc.bat
  MATLAB = C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a
  -> COMPILER = lcc
  -> Compiler flags:
  COMPFLAGS = -c -Zp8 -I"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\include" -DMATLAB_MEX_FILE -noregistrylookup
  OPTIMFLAGS = -DNDEBUG
  DEBUGFLAGS = -g4
  arguments =
  Name switch = -Fo
  -> Pre-linking commands =
  -> LINKER = lcclnk
  -> Link directives:
  LINKFLAGS = -tmpdir "." -dll "C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\extern\lib\win32\lcc\mexFunction.def" -L"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\lib" -libpath "C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\extern\lib\win32\lcc" C:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\templib2.obj
  LINKDEBUGFLAGS =
  LINKFLAGSPOST = libmx.lib libmex.lib libmat.lib
  Name directive = -o "interface.mexw32"
  File link directive =
  Lib. link directive =
  Rsp file indicator = @
  -> Resource Compiler = lrc -I"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\include" -noregistrylookup -fo"mexversion.res"
  -> Resource Linker =
  ----------------------------------------------------------------
  
  
  --> lcc -c -Zp8 -I"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\include" -DMATLAB_MEX_FILE -noregistrylookup -FoC:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\interface.obj -IC:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\extern\include -IC:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\simulink\include -DNDEBUG -DMX_COMPAT_32 "X:\interface.c"
  
  
  --> lcc -c -Zp8 -I"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\include" -DMATLAB_MEX_FILE -noregistrylookup "C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\mex\lccstub.c" -FoC:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\templib2.obj
  
  Contents of C:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\mex_tmp.rsp:
  C:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\interface.obj algo.obj
  
  
  --> lcclnk -o "interface.mexw32" -tmpdir "." -dll "C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\extern\lib\win32\lcc\mexFunction.def" -L"C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\sys\lcc\lib" -libpath "C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008a\extern\lib\win32\lcc" C:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\templib2.obj -s @C:\DOCUME~1\wt0t1123\LOCALS~1\Temp\mex_pL7KD9\mex_tmp.rsp libmx.lib libmex.lib libmat.lib
  
  Writing library for interface.mexw32
  algo.obj .text: undefined reference to '_expf'
  algo.obj .text: undefined reference to '___powr4i4'
  algo.obj .text: undefined reference to '_powf'
  algo.obj .text: undefined reference to '_tanf'
  algo.obj .text: undefined reference to '_for_stop_core'
  algo.obj .text: undefined reference to '_for_cpystr'
  algo.obj .text: undefined reference to '_for_close'
  algo.obj .text: undefined reference to '_logf'
  
  C:\PROGRA~1\MATLAB\R2008A\BIN\MEX.PL: Error: Link of 'interface.mexw32' failed.
  
  ??? Error using ==> mex at 207
  Unable to complete successfully.
  
  >>

Pour info j'ai rajouter la librairie libm.lib qui se trouve dans un répertoire du compilateur Fortran, en utilisant les options -L et -l de la commande mex, et c'est ainsi qu'apparaissent par la suite d'autre "undefined reference"...

Voilà désolé pour la tartine mais je voulais donner le plus d'infos possible.
En espérant que quelqu'un aura une idée pour résoudre mon problème, que ce soit une erreur de configuration du linker, ou même une mauvaise façon de compiler...

Pour toute autre question n'hésitez pas...

Dans l'attente de votre aide,
Merci d'avance !
Philippe

[Jerome Briot]

Alors... je n'ai jamais mixé des fichiers C et Fortran... et je n'utilise ni Simulnk ni RTW

Je suppose que tu as déjà lu ceci : Creating Fortran S-Functions

Si oui, as-tu essayé de compiler les exemples fournis dans la documentation ?

Je vois aussi que tu utilises le compilateur LCC, as-tu essayé avec un autre ?
=> Quels sont les différents compilateurs supportés ?

[filou2931]

Bonjour,

Et merci pour ta réponse.

Effectivement j'ai déjà consulté la doc "Creating Level-2 Fortran S-Function", ce qui m'a permis de comprendre le principe pour intégrer du code Fortran, avec en particulier le besoin de "wrapper" le code Fortran avec une interface codée en C.

Je ne peux pas utiliser d'autre compilateur que LCC puisque je n'ai que celui-là d'installé sur ma machine, mais à priori je n'ai rien vu dans la doc ou sur le net une info montrant l'incompatibilité de LCC pour mon besoin.

Je viens de voir que la librairie math Fortran est libf2c, librairie que je n'ai pas (celle qui est avec mon compilo Fortran est libm), je vais donc tenter de la récupérer pour faire la compilation avec, sans trop me faire d'illusion...

Dans la foulée j'essaierai un des exemple de la doc, mais de toute façon je ne pense pas que cela vienne du compilo mais bien du link, puisque je réussi à générer le tout avec une subroutine Fortran vide. Les problèmes apparaissent en codant un algo faisant référence à des fonctions externes et donc à des librairies Fortran...

Le tout est de savoir comment faire un bon link...

Si quelqu'un a des infos à ce sujet...
Merci

Philippe

[salseropom]

Salut, je passe ma vie à faire communiquer du C, fortran et Matlab. Je travaille avec Visual Studio 2005. Dans la pratique j'ai ceci :

Matlab appelle du C qui appelle du fortran qui appelle du C qui appelle du fortran qui appelle du C. Tout simplement car j'ai des morceaux de mon code en C, d'autres en fortran et que mes utilisateurs utilisent Matlab.

Voici comment je fais :
Tu génères avec Visual Studio autant de .dll qu'il te faut
Tu fais un joli mex-file que tu compiles avec Visual Studio (et non pas avec Matlab chose que je n'ai jamais faite)
Et c'est gagné !

Je répète : tout est compilé par Visual Studio. Je n'utilise jamais la commande mex...

J'espère que j'ai répondu à ta question