Discussion :

[annesophiedecar]

Bonsoir à tous,
Je suis un peu débutante avec Lunix. j'ai un algorithme contenant un ensemble de classe en C++ à compiler sous Linux. Une des classes utilise une librairie svm-2.82.
Mon problème c'est que lorsque je compile j'obtiens des erreurs lièe à cette librairie comme suit:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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anne@anne-desktop:~/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build/tutorial/Application$ make
[ 31%] Built target eoutils
[ 45%] Built target eo
[ 77%] Built target es
[ 93%] Built target ga
Linking CXX executable AppEA
CMakeFiles/AppEA.dir/AppEA.cpp.o: In function `loocv_svm_classifier(std::vector<bool, std::allocator<bool> > const&, double&)':
AppEA.cpp:(.text+0xcee): undefined reference to `svm_check_parameter'
AppEA.cpp:(.text+0xd02): undefined reference to `svm_train'
AppEA.cpp:(.text+0xd43): undefined reference to `svm_cross_validation'
AppEA.cpp:(.text+0xd9e): undefined reference to `svm_predict'
AppEA.cpp:(.text+0xe8e): undefined reference to `svm_destroy_model'
collect2: ld a retourné 1 code d'état d'exécution
make[2]: *** [tutorial/Application/AppEA-1.02] Erreur 1
make[1]: *** [tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/all] Erreur 2
make: *** [all] Erreur 2

Je ne sais pas vraiment ou devrais je mettre la librarie et est ce que je dois écrire quelque chose dans le Makefile ou CMakeLists.txt ou je ne sais pas afin que mon programme reconnait cette librairie?
Svp j'ai vraiment besoin de votre aide!
Merci d'avance .
Cordialement, Anne Sophie de Carbonnière.

[CedrX]

Dans ton Makefile il ne manquerait pas un

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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LDFLAGS ="-Lsvm2"

Parce que là d'après ce qui en ressort il ne trouve pas de références aux fonctions typiques à la librairie svm.

[annesophiedecar]

Bonjour,
j'ai ajouté à mon makefile ce que vous m'avez dit comme suit:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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# CMAKE generated file: DO NOT EDIT!
# Generated by "Unix Makefiles" Generator, CMake Version 2.6
 
# Default target executed when no arguments are given to make.
default_target: all
.PHONY : default_target
 
#=============================================================================
# Special targets provided by cmake.
 
# Disable implicit rules so canoncical targets will work.
.SUFFIXES:
 
# Remove some rules from gmake that .SUFFIXES does not remove.
SUFFIXES =
 
.SUFFIXES: .hpux_make_needs_suffix_list
 
# Suppress display of executed commands.
$(VERBOSE).SILENT:
 
# A target that is always out of date.
cmake_force:
.PHONY : cmake_force
 
#=============================================================================
# Set environment variables for the build.
 
# The shell in which to execute make rules.
SHELL = /bin/sh
 
# The CMake executable.
CMAKE_COMMAND = /usr/local/bin/cmake
 
# The command to remove a file.
RM = /usr/local/bin/cmake -E remove -f
 
# The top-level source directory on which CMake was run.
CMAKE_SOURCE_DIR = /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo
 
# The top-level build directory on which CMake was run.
CMAKE_BINARY_DIR = /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build
 
#=============================================================================
# Targets provided globally by CMake.
 
# Special rule for the target edit_cache
edit_cache:
	@$(CMAKE_COMMAND) -E cmake_echo_color --switch=$(COLOR) --cyan "Running interactive CMake command-line interface..."
	/usr/local/bin/cmake -i .
.PHONY : edit_cache
 
# Special rule for the target edit_cache
edit_cache/fast: edit_cache
.PHONY : edit_cache/fast
 
# Special rule for the target rebuild_cache
rebuild_cache:
	@$(CMAKE_COMMAND) -E cmake_echo_color --switch=$(COLOR) --cyan "Running CMake to regenerate build system..."
	/usr/local/bin/cmake -H$(CMAKE_SOURCE_DIR) -B$(CMAKE_BINARY_DIR)
.PHONY : rebuild_cache
 
# Special rule for the target rebuild_cache
rebuild_cache/fast: rebuild_cache
.PHONY : rebuild_cache/fast
 
# Special rule for the target test
test:
	@$(CMAKE_COMMAND) -E cmake_echo_color --switch=$(COLOR) --cyan "Running tests..."
	/usr/local/bin/ctest --force-new-ctest-process $(ARGS)
.PHONY : test
 
# Special rule for the target test
test/fast: test
.PHONY : test/fast
 
# The main all target
all: cmake_check_build_system
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(CMAKE_COMMAND) -E cmake_progress_start /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build/CMakeFiles /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build/tutorial/Application/CMakeFiles/progress.make
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f CMakeFiles/Makefile2 tutorial/Application/all
	$(CMAKE_COMMAND) -E cmake_progress_start /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build/CMakeFiles 0
.PHONY : all
 
# The main clean target
clean:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f CMakeFiles/Makefile2 tutorial/Application/clean
.PHONY : clean
 
# The main clean target
clean/fast: clean
.PHONY : clean/fast
 
# Prepare targets for installation.
preinstall: all
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f CMakeFiles/Makefile2 tutorial/Application/preinstall
.PHONY : preinstall
 
# Prepare targets for installation.
preinstall/fast:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f CMakeFiles/Makefile2 tutorial/Application/preinstall
.PHONY : preinstall/fast
 
# clear depends
depend:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(CMAKE_COMMAND) -H$(CMAKE_SOURCE_DIR) -B$(CMAKE_BINARY_DIR) --check-build-system CMakeFiles/Makefile.cmake 1
.PHONY : depend
 
# Convenience name for target.
tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/rule:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f CMakeFiles/Makefile2 tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/rule
.PHONY : tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/rule
 
# Convenience name for target.
AppEA: tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/rule
.PHONY : AppEA
 
# fast build rule for target.
AppEA/fast:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/build
.PHONY : AppEA/fast
 
# Convenience name for target.
tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/rule:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f CMakeFiles/Makefile2 tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/rule
.PHONY : tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/rule
 
# Convenience name for target.
AppLibEA: tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/rule
.PHONY : AppLibEA
 
# fast build rule for target.
AppLibEA/fast:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build
.PHONY : AppLibEA/fast
 
AppEA.o: AppEA.cpp.o
.PHONY : AppEA.o
 
# target to build an object file
AppEA.cpp.o:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/AppEA.cpp.o
.PHONY : AppEA.cpp.o
 
AppEA.i: AppEA.cpp.i
.PHONY : AppEA.i
 
# target to preprocess a source file
AppEA.cpp.i:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/AppEA.cpp.i
.PHONY : AppEA.cpp.i
 
AppEA.s: AppEA.cpp.s
.PHONY : AppEA.s
 
# target to generate assembly for a file
AppEA.cpp.s:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/AppEA.cpp.s
.PHONY : AppEA.cpp.s
 
AppLibEA.o: AppLibEA.cpp.o
.PHONY : AppLibEA.o
 
# target to build an object file
AppLibEA.cpp.o:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/AppLibEA.cpp.o
.PHONY : AppLibEA.cpp.o
 
AppLibEA.i: AppLibEA.cpp.i
.PHONY : AppLibEA.i
 
# target to preprocess a source file
AppLibEA.cpp.i:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/AppLibEA.cpp.i
.PHONY : AppLibEA.cpp.i
 
AppLibEA.s: AppLibEA.cpp.s
.PHONY : AppLibEA.s
 
# target to generate assembly for a file
AppLibEA.cpp.s:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/AppLibEA.cpp.s
.PHONY : AppLibEA.cpp.s
 
make_App.o: make_App.cpp.o
.PHONY : make_App.o
 
# target to build an object file
make_App.cpp.o:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/make_App.cpp.o
.PHONY : make_App.cpp.o
 
make_App.i: make_App.cpp.i
.PHONY : make_App.i
 
# target to preprocess a source file
make_App.cpp.i:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/make_App.cpp.i
.PHONY : make_App.cpp.i
 
make_App.s: make_App.cpp.s
.PHONY : make_App.s
 
# target to generate assembly for a file
make_App.cpp.s:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(MAKE) -f tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/build.make tutorial/Application/CMakeFiles/AppLibEA.dir/make_App.cpp.s
.PHONY : make_App.cpp.s
 
# Help Target
help:
	@echo "The following are some of the valid targets for this Makefile:"
	@echo "... all (the default if no target is provided)"
	@echo "... clean"
	@echo "... depend"
	@echo "... AppEA"
	@echo "... AppLibEA"
	@echo "... edit_cache"
	@echo "... rebuild_cache"
	@echo "... test"
	@echo "... AppEA.o"
	@echo "... AppEA.i"
	@echo "... AppEA.s"
	@echo "... AppLibEA.o"
	@echo "... AppLibEA.i"
	@echo "... AppLibEA.s"
	@echo "... make_App.o"
	@echo "... make_App.i"
	@echo "... make_App.s"
.PHONY : help
 
 
 
#=============================================================================
# Special targets to cleanup operation of make.
 
# Special rule to run CMake to check the build system integrity.
# No rule that depends on this can have commands that come from listfiles
# because they might be regenerated.
cmake_check_build_system:
	cd /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build && $(CMAKE_COMMAND) -H$(CMAKE_SOURCE_DIR) -B$(CMAKE_BINARY_DIR) --check-build-system CMakeFiles/Makefile.cmake 0
.PHONY : cmake_check_build_system
LDFLAGS = "-L /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/src/libsvm-2.82/"

mais l'erreur persiste encore:

Code :

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anne@anne-desktop:~/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build/tutorial/Application$ make
-- Configuring done
WARNING: Target "AppEA" requests linking to directory "/home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/src/libsvm-2.82".  Targets may link only to libraries.  CMake is dropping the item.
WARNING: Target "AppLibEA" requests linking to directory "/home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/src/libsvm-2.82".  Targets may link only to libraries.  CMake is dropping the item.
-- Generating done
-- Build files have been written to: /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build
[ 31%] Built target eoutils
[ 45%] Built target eo
[ 77%] Built target es
[ 93%] Built target ga
[ 95%] Building CXX object tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/AppEA.cpp.o
Linking CXX executable AppEA
CMakeFiles/AppEA.dir/AppEA.cpp.o: In function `loocv_svm_classifier(std::vector<bool, std::allocator<bool> > const&, double&)':
AppEA.cpp:(.text+0xcee): undefined reference to `svm_check_parameter'
AppEA.cpp:(.text+0xd02): undefined reference to `svm_train'
AppEA.cpp:(.text+0xd43): undefined reference to `svm_cross_validation'
AppEA.cpp:(.text+0xd9e): undefined reference to `svm_predict'
AppEA.cpp:(.text+0xe8e): undefined reference to `svm_destroy_model'
collect2: ld a retourné 1 code d'état d'exécution
make[2]: *** [tutorial/Application/AppEA-1.02] Erreur 1
make[1]: *** [tutorial/Application/CMakeFiles/AppEA.dir/all] Erreur 2
make: *** [all] Erreur 2

je ne sais pas quoi faire?est ce que la librairie doit être placer dans un emplacement particulier pour que ça marche?aidez moi SVP.Merci infiniment.

[CedrX]

En fait je n'aurais pas fait comme ça.
Sur quelle distribution es tu ?
N'y a t'il pas possibilité d'installer directement la librairie libsvm2 par l'intermédiaire de paquets?
Comme un bon vieux apt-get install le ferait sur une debian ou une ubuntu

Code :

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apt-get install libsvm2

En plus je ne suis pas persuadé que mettre le LDFLAGS à la fin de ton makefile influe sur la compilation des sources. (Moi je l'airais mis plus au début)

Est ce que tu pourrais nous donner (en gros) le contenu du répertoire /home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/src/libsvm-2.82/
Y a t'il un répertoire include en dessous de ce répertoire?
Si oui je pense qu'il va aussi falloir jouer avec les CPPFLAGS

Code :

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CPPFLAGS="-I/home/anne/Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/src/libsvm-2.82/include"

[annesophiedecar]

Tout d'abord merci pour votre aide.
Je travaille sur ubuntu. j'ai essayé avec la commande apt get install mais ça ne marche pas(
Bon voila une description de mon projet:
Je travaille sous une plateforme qui s'appelle Paradiseo pour les algorithmes évolutionnaires.
bref j'ai un dossier Application: qui contient les classes du code source en c++, le CMakelist.txt et le makefile.am
et les exécutables sous un autre dossier: /Bureau/paradiseo-1.2.1/paradiseo-eo/build/tutorial/Application
contenat le makefile et le sous dossier CMakeFiles contenant deux sous dossiers chaqu'un contient: le build.make
cmake_clean.cmake
cmake_clean_target.cmake
CXX.includecache
depend.internal
depend.make
depend.make.mark
DependInfo.cmake
flags.make
link.txt
progress.make


bref le problème vient essentiellement de la librairie libsvm que j'ai pas su où la mettre pour que ça marche ni ce que je dois ajouter comme code.
Dans un autre forum celui de la plateforme elle même on m'a dit d'ajouter INCLUDE_DIRECTORY(cheminvers la librairie) dans le CMakeLists.txt mais ça n'a rien changé(

est ce que je dois la mettre sous /usr/include/ ?

[annesophiedecar]

et si je mettais le svm.h qui appartient à la librairie et que j'utilise comme par exemple le include <cmath>? ça marcherait?

[CedrX]

Regardes cette page, la librairie libsvm2 est disponible depuis la version 8.04 de ubuntu.

apt get install mais ça ne marche pas(

Quel est le message d'erreur ?

est ce que je dois la mettre sous /usr/include/ ?

Non c'est pas très propre, il vaudrait mieux que tu trouves un moyen d'indiquer au compilateur où aller chercher la librairie libsvm2 et les fichiers headers qui y sont associés

[annesophiedecar]

en fait lorsque je tape apt-get voila l'erreur qui me parait

Code :

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anne@anne-desktop:~/Bureau$ sudo apt-get install libsvm-2.82
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances       
Lecture des informations d'état... Fait
E: Impossible de trouver le paquet libsvm-2.82

je vous ai envoyé la libsvm-2.82 peu etre qu'il y quelque chose qui cloche
vraiment j'arrive pas à m'en sortir.

Merci.
Cordialement, Anne Sophie De carbonnière

[CedrX]

En fait le nom du paquet est libsvm2.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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cedrx@debian:~$ apt-cache search libsvm2
libsvm2 - The LIBSVM shared library

Donc pour l'installer: (avec les droits root)

Code :

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apt-get install libsvm2

[annesophiedecar]

j'ai tapé:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

apt-cache search libsvm2

mais rien ne se passe et puis
lorsque je tape apt-get install rien ne change toujours la même erreur

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances       
Lecture des informations d'état... Fait
E: Impossible de trouver le paquet libsvm2

en fait le paquet c'est libsvm-2.82 et non pas libsvm2

[annesophiedecar]

il y aurait il un autre moyen d'installer cette librairie?
Merci infiniment pour votre aide.

[CedrX]

Code :

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cedrx@debian:~$ apt-cache showpkg libsvm2
Package: libsvm2
Versions:
2.85.0-1 (/var/lib/apt/lists/debian.mines.inpl-nancy.fr_debian_dists_lenny_main_binary-i386_Packages)
 Description Language:
                 File: /var/lib/apt/lists/debian.mines.inpl-nancy.fr_debian_dists_lenny_main_binary-i386_Packages
                  MD5: 2db3b2b0cf0a3d549d81a270bfacec8d

2.82.0-3 (/var/lib/apt/lists/debian.mines.inpl-nancy.fr_debian_dists_etch_main_binary-i386_Packages)
 Description Language:
                 File: /var/lib/apt/lists/debian.mines.inpl-nancy.fr_debian_dists_etch_main_binary-i386_Packages
                  MD5: 138d818b2f69e6d225c167204d46a00a
...

en fait le paquet c'est libsvm-2.82 et non pas libsvm2

Ce n'est que le nom du paquet pas la version de la librairie.
Moi j'utilise debian et la version et ce qui est au dessus montre qu'en debian lenny c'est la version 2.85.0-1 qui est disponible.
Et qu'en debian etch c'est la version 2.82.0-3

Quelle version d'ubuntu utilises tu ?

[annesophiedecar]

moi j'utilise Ubuntu 7.10

[annesophiedecar]

lorsque je tape apt-cache showpkg libsvm2 voila l'erreur que j'ai:
W: Impossible de trouver le paquet libsvm2
je ne sais pas ce que je devrais faire?

[estofilo]

D'après la page ici:
https://launchpad.net/ubuntu/gutsy/i386/libsvm-dev
(sachant que Gutsy correspond à la version 7.10 d'ubuntu), je dirais que:

Code :

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apt-get install libsvm-dev

a des chances de convenir.
Ne pas oublier qu'il faut être root pour cette commande, ou alors faire:

Code :

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sudo apt-get install libsvm-dev

Le package -dev est nécessaire pour développer avec la librairie.

[annesophiedecar]

merci pour votre réponse mais malheureusement pour moi ça l'air de ne pas marcher

Code :

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anne@anne-desktop:~/Bureau$ sudo apt-get install libsvm-dev
[sudo] password for yosra:
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances       
Lecture des informations d'état... Fait
E: Impossible de trouver le paquet libsvm-dev

svp est ce vous avez idée de ce que je devrais faire

[CedrX]

Il me semble que ubuntu dans sa version 7.10 n'est désormais plus supportée.
Est ce que tu as possibilité de passer à une version supérieure de ubuntu ?

[annesophiedecar]

il n'y a t il aucune autre solution à votre avis avant de passer à une autre nouvelle version?

[annesophiedecar]

est ce que je passerais à une autre version de Ubuntu ou bien une autre distribution de Lunix?

[estofilo]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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anne@anne-desktop:~/Bureau$ sudo apt-get install libsvm-dev
[...]
E: Impossible de trouver le paquet libsvm-dev

Argh. Est-il possible de voir le contenu du fichier /etc/apt/sources.list ?
(c'est ce fichier qui indique à apt-get où chercher les paquets).
D'autre part à tout hasard il faut lancer

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

sudo apt-get update

pour rafraîchir la liste globale des paquets.
Et ensuite, faire

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

apt-cache search libsvm

histoire d'avoir une information actualisée.