Discussion :

[Jasmine80]

Bonjour,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT accession, organism, seq_length, sequence 
FROM fungi2 
WHERE organism = 'orga1' 
AND seq_length = (
    SELECT MAX(seq_length) 
    FROM fungi2 
    WHERE organism = 'orga1'
)

Y a-t-il moyen de faire plus simple, sans utiliser de sous requêtes?

J'ai 14 organismes différents, j'effectue donc 14 fois cette requête, est-ce simplifiable?


Merci,

[Maljuna Kris]

Saluton,
Eh bien non, je ne vois pas comment tu pourrais ici remplacer la sous-requête par une jointure.
Par contre tu peux corréler la sous-requête pour sortir les 14 organismes d'une seule requête

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT f1.accession, f1.organism, f1.seq_length, f1.sequence 
FROM fungi2 f1
WHERE f1.seq_length = (
    SELECT MAX(f2.seq_length) 
    FROM fungi2 f2
    WHERE f1.organism = f2.organism)

Le problème c'est que MySQL n'apprécie pas vraiment les sous-requêtes corrélées.

[ced]

Bonjour,

La seule façon de passer par une jointure, c'est de mettre la sous-requête dans une table temporaire (bref, de faire ça "à l'ancienne" dans MySQL).

ced

[papa6]

Bonjour,

Je dois être spécialisé dans les jointures tordues ...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT t1.accession, t1.organism, t1.seq_length, t1.sequence
FROM fungi2 AS t1
LEFT JOIN fungi2 AS t2 ON t1.organism = t2.organism
GROUP BY t1.organism
HAVING t1.seq_length = MAX(t2.seq_length)

(Je me suis inspiré d'une vieille discussion)

[ced]

Ouh là... C'est pas la jointure qui est tordue, là . C'est l'utilisation "plus que limite" du GROUP BY dans MySQL.
Aucun autre SGBD n'accepterait cette syntaxe, et telle quelle, je ne la recommanderais pas .

Un peu de lecture pour comprendre pourquoi : http://cedric-duprez.developpez.com/...fier-group-by/

ced

[papa6]

(Éh bien Ced, tu m'as donné de la lecture aujourd'hui)

Pourtant sur ce coup-là, il me semble que c'est bien un "group by" qu'il faut :

J'ai 14 organismes différents, j'effectue donc 14 fois cette requête

Cette requête ne retourne qu'un seul résultat. On va donc la faire passer intégralement pour avoir les 14 résultats.
Et pour le plus grand "seq_length", pour chaque organisme, on doit utiliser un MAX : il faut une aggrégation GROUP BY, on ne peut pas y échapper

Par contre, je conviens que d'autres fois, l'utilisation de Group by est plus que discutable, et alors que je tendais à faire figurer le plus de champs dans les Group by, la lecture de ton article me fait faire marche arrière (je croyais que c'était une recommandation de la norme).

[Jasmine80]

Merci beaucoup mais aucune de ces 2 requêtes ne fonctionne. MySQL rame et n'arrive pas à les éxécuter, il essaie pendant 5 minutes puis affiche un écran tout blanc. J'ai déjà remarqué que je dois garder des requêtes simples et pas trop lourdes où sinon elles ne fonctionnent pas. De plus, je ne sais pas ce que mo disque dur a ce matin mais bien que 95% du processeur soit inactif, il tourne et fait plein de bruit.

[Maljuna Kris]

De plus, je ne sais pas ce que mo disque dur a ce matin mais bien que 95% du processeur soit inactif, il tourne et fait plein de bruit.

Une gastro ?

[Jasmine80]

Une gastro ?

lol ... faut pas rire avec ces choses là, il va peut-être rendre l'âme.
Je vais tout faire afin de le chouchouter, j'ai débuté doucement le traitement avec un CCleaner, ce midi il aura droit à une petite défragmentation mais je doute que cela le soigne vraiment. On verra si il passe la nuit et si il se sent mieux demain. Peut-être que je m'inquiète inutilement et que c'est simplement le service informatique qui est entrain d'exécuter un backup à distance. Quoiqu'il en soit, sa mémoire survivra car tout est bien sauvegardé. Le corps périt mais l'âme subsiste. Faut bien laisser la place aux jeunes parfois

[Maljuna Kris]

Faut bien laisser la place aux jeunes parfois

Tu ne dis pas ça pour moi, tout de même, si ?

[Jasmine80]

Tu ne dis pas ça pour moi, tout de même, si ?

faut pas être si parano La jeunesse est dans la tête non? Tant qu'on se sent jeune, on est jeune. L'inverse est également vrai, on voit parfois des personnes de 20 ayant l'air déjà complètement lassées de la vie. Mais arrêtons de philosopher, ce n'est pas un forum prévu pour cela.

[Maljuna Kris]

...pour le plus grand "seq_length", pour chaque organisme, on doit utiliser un MAX : il faut une aggrégation GROUP BY, on ne peut pas y échapper.

J'ai quand même un doute sur la pertinence du MAX(t2.seq_length) que l'on va récupérer, doute que fait naître l'absence de t1.accession dans le GROUP BY.

[papa6]

Bonsoir,

Au temps pour moi... je viens de m'apercevoir que j'avais mal rédigé mon group by, car il faut d'une part le grouper par organisme, mais ensuite par seq_length, pour n'en garder que le maximum :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT t1.accession, t1.organism, t1.seq_length, t1.sequence
FROM fungi2 AS t1
LEFT JOIN fungi2 AS t2 ON t1.organism = t2.organism
GROUP BY t1.organism, t1.seq_length
HAVING t1.seq_length = MAX(t2.seq_length)

Quant à ton DD, il faut le bichonner, et non pas le faire travailler à fond avec une défrag ou un CCleaner.

Quand mon disque est sur le point de lâcher, je le laisse se reposer et je travaille avec des OS sur CD comme Puppy linux qui est peu gourmand. Mais bon, faut pas être dérangé par linux

Alors cette nouvelle proposition de requête ?