Discussion :

[Jasmine80]

cpan> install Boulder::Genbank

CPAN: Storable loaded ok
Going to read /home/user/.cpan/Metadata
Database was générate on True, 12 Aug 2008 03:02:51 GMT
Running install for module Boulder::Genbank
Running make for L/LD/LDS/Boulder-1.30.tar.gz
CPAN : LWP::UserAgent loaded ok
Fetching with LWP ftp://cpan.mirrors.skynet.be/pub/CPA...er-1.30.tar.gz
Useless content call in void context at /usr/share/perl15/LWP/Protocol/ftp.pm line 398
LWP failed with code[400] message[FTP return code 000]
Fetching with Net::FTP: ftp://cpan.mirrors.skynet.be/pub/CPA...1mailrc.txt.gz
Couldn't fetch 01mailrc.txt.gz from cpan.mirrors.skynet.be
Fetching with LWP: ftp://cpan.belnet.be/mirror/ftp.cpan...1mailrc.txt.gz
Useless content call in void context at /usr/share/perl15/LWP/Protocol/ftp.pm line 398
LWP failed with code[400] message[FTP return code 000]
Fetching with Net::FTP: ftp://ftp.belnet.be/mirror/ftp.cpan....1mailrc.txt.gz
Couldn't fetch 01mailrc.txt.gz from ftp.belnet.be
Fetching with LWP : ftp://ftp.easynet.be/pub/CPAN/authors/01mailrc.txt.gz
Couldn't fetch 01mailrc.txt.gz from ftp.easynet.be
Fetching with LWP : ftp://ftp.kulnet.ac.be/pub/mirror/CP...1mailrc.txt.gz
LWP failed with code[404] message[File '01mailrc.txt.gz' not found]
Fetching with LWP : ftp://ftp.kulnet.kuleuven.ac.be/pub/...1mailrc.txt.gz
Couldn't fetch 01mailrc.txt.gz from ftp.kulnet.kuleuven.ac
Going to read /home/user/.cpan/sources/authors/01mailrc.txt.gz
Fetching with LWP : ftp://ftp.cpan.mirrors.skynet.be/pub...details.txt.gz
Useless content call in void context at /usr/share/perl15/LWP/Protocol/ftp.pm line 398
LWP failed with code[400] message[FTP return code 000]
Fetching with Net::FTP: ftp://cpan.mirrors.skynet.be/pub/CPA...details.txt.gz
Couldn't fetch 02packages.details.txt.gz from cpan.mirrors.skynet.be
Fetching with Net::FTP: ftp://ftp.belnet.be/mirror/ftp.cpan....details.txt.gz

...

There's a new CPAN.pm version (v1.9205) avalaible
[Current version is v1.7602]
You might want to try install Bundle::CPAN
reload cpan

>QUIT

cpan> install Bundle::CPAN

CPAN: Storable loaded ok
Going to read /home/user/.cpan/Metadata
Database was générate on True, 12 Aug 2008 03:02:51 GMT
Running install for module Boulder::Genbank
Running make for L/LD/LDS/Boulder-1.30.tar.gz
CPAN : LWP::UserAgent loaded ok

Fetching with Net::FTP: ftp://cpan.mirrors.skynet.be/pub/CPA...odlist.data.gz
...

teste les autres 'dépôts' et ne trouve jamais rien, même erreur code[400]


Pourriez-vous m'expliquer le problème?

Merci beaucoup,

[Jasmine80]

Voici le message que j'ai en voulant installer le module

cpan> install Boulder::Genbank

...
Boulder-1.30/Boulder.pod
Boulder-1.30/Makefile.pl
Boulder-1.30/genbank.pl
Boulder-1.30/docs/
...
Checking if your kit is complete...
Looks good
Writting Makefile for Boulder
-- NOT OK
Running make test
Can't test without successful make
Running make install
make had returned bad status, install seems impossible

Comment faire afin d'avoir ce message dans un fichier texte?

install Boulder::Genbank > file.txt

[Invité]

Salut,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
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8
Fetching with LWP ftp://cpan.mirrors.skynet.be/pub/CPA...er-1.30.tar.gz
Useless content call in void context at /usr/share/perl15/LWP/Protocol/ftp.pm line 398
LWP failed with code[400] message[FTP return code 000]
Fetching with Net::FTP: ftp://cpan.mirrors.skynet.be/pub/CPA...1mailrc.txt.gz
Couldn't fetch 01mailrc.txt.gz from cpan.mirrors.skynet.be
Fetching with LWP: ftp://cpan.belnet.be/mirror/ftp.cpan...1mailrc.txt.gz
Useless content call in void context at /usr/share/perl15/LWP/Protocol/ftp.pm line 398
LWP failed with code[400] message[FTP return code 000]

tu devrais configurer ton CPAN pour se connecter en mode passif au serveur ftp:

Pour cela, tu définis la variable d'environnement FTP_PASSIVE dans le shell du user utilisant le cpan:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
$export FTP_PASSIVE=1

Pour vérifier que ta variable soit bien définie:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
$echo $FTP_PASSIVE

ensuite tu te connectes au cpan et tu essaies de rapatrier le module en question:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
 
$cpan 
cpan> install ...

Normallement ça devrait fonctionner.

[Jasmine80]

Merci pour tes conseils.

Je vais essayer de modifier cette variable directement par le shell sous linux.

Si jamais je n'y arrive pas puis-je utiliser ce module sous Windows?http://search.cpan.org/~gbarr/libnet-1.22/Net/FTP.pm cela changerait il les variables d'environnement linux?

[Jasmine80]

J'ai fait

> perl -e $export FTP_PASSIVE = 1

rien ne s'affiche à l'écran

> $echo $export

rien ne s'affiche à l'écran

> echo $export

un saut de ligne apparait à l'écran

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

> cpan

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

cpan> install Boulder::Genbank

... mêmes messages d'erreur snif

[Invité]

Re,
export n'est pas une variable mais une commande shell.
Il en faut donc pas de $

Execute cette commande directement au niveau du shell.

initialisation de la variable d'environnement FTP_PASSIVE

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
[user@mvts~] export FTP_PASSIVE=1

Affichage de la valeur de la variable d'environnement

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
 
[user@mvts~] echo $FTP_PASSIVE
1
[user@mvts~]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
 
[user@mvts~] cpan
cpan> install ...

[Jasmine80]

Lors d'un précédent sujet, j'avais :

1) j'ai installé "build-essential" et "unzip"
2) j'ai recherché les localisations de make et unzip qui étaient 'bin/make' et 'bin/unzip'
3) j'ai été sur le CPAN en mode interactif via perl -MCPAN -e shell
4) j'ai indiqué les emplacements de make et unzip
o conf make /bin/make
o conf unzip /bin/unzip

... pour le reste, je regarderai demain car maintenant je n'ai pas le temps.

Un grand merci pour ton aide, je te tiens au courant de la suite.

[Jasmine80]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

[user@mvts] dpkg -l  | grep -i make

J'obtiens

ii friendly-recovery 0.1 Make recovery more user-friendly
ii make 3.81-3build1 The GNU version of the "make" utility.
ii makedev 2.3.1-84ubuntu1 creates device files in /dev
ii mktemp 1.5-5ubuntu2 Makes unique filenames for temporary files

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

[user@mvts] which make

/usr/bin/make

Cela te semble t'il correct?



Pour l'installation manuelle, tout fonctionne jusqu'à 'perl Makefile.pl' où j'obtiens l'erreur disant qu'il ne peut pas l'ouvrir car il n'y a ni répertoire ou fichier de ce nom.


Merci beaucoup,

[Invité]

Ok

peux-tu reconfigurer ton cpan pour qu'il utilise

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
/usr/bin/make

au lieu de

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
/bin/make

et voir ce que ça donne.

[djibril]

Fais ceci :

apt-get install libstdc++6-dev libstdc++5 gcc

[Jasmine80]

J'ai correctement installé libstdc++6-dev libstdc++5 gcc mais ensuite quand via le CPAN je fais "install Boulder::Genbank', j'ai exactement le même message qu'avant :

cpan> install Boulder::Genbank

...
Boulder-1.30/Boulder.pod
Boulder-1.30/Makefile.pl
Boulder-1.30/genbank.pl
Boulder-1.30/docs/
...
Removing previously used home/user/.cpan/build/Boulder-1.30
Checking if your kit is complete...
Looks good
Writting Makefile for Boulder
-- NOT OK
Running make test
Can't test without successful make
Running make install
make had returned bad status, install seems impossible

Merci pour votre aide,

[Invité]

Tu as bien utilisé /usr/bin/make?

Pour vérifier:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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2
3
 
cpan> o conf make
    make               /usr/bin/make

sinon
Peux-tu installer le package manuellement pour voir s'il n'y a pas d'autres erreurs qui s'affichent.

[user@mvts] wget http://search.cpan.org/CPAN/authors/...er-1.30.tar.gz
[user@mvts] tar -xzvf Boulder-1.30.tar.gz
[user@mvts] cd Boulder-1.30
[user@mvts] perl Makefile.pl
[user@mvts] make
[user@mvts] make test
[user@mvts] make install