Discussion :

[solen]

Bonjour à tous,

moi qui suis habituée au perl, je suis confrontée au manque de petite fonction pratique du C pour le traitement des chaînes de caractères (à moins que je ne les connaissent pas...).
Je vous explique brièvement mon problème. Je vous prie à l'avance de bien vouloir m'excuser si je n'emploie pas les bon termes)
Je possède une chaine de caractère: char ligne [1000] et cette ligne est de la forme: "0.1\t0.7\t1.6\t-0.8\t......\t0.8\n" et j'aimerai transformer cette chaine en un tableau de double ou chaque case contiendrai un élément.

J'ai essayé pas mal de chose avec strtok, mais je n'y arrive pas.
Je vous mets mon code pour essayer d'etre plus clair:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <stdlib.h>
 
int main (int argc, char *argv[]){
     int taille=atoi(argv[1]),j; 
     char ligne[10000];
     double *A = malloc(taille*sizeof(double));
     FILE *file;
 
     if ((file = fopen(argv[2],"r"))==NULL){
		fprintf(stderr,"impossible d'ouvrir le fichier en lecture\n");
     }
     while (fgets(ligne,10000,file)!=NULL){
		for(j=0;j<taille;j++){
			char * gene1 = strtok(ligne,"\t");
			printf("%s\n",gene1);  //affiche tjs le premier element
			A[j] = atof(gene1);
		}
	}
return 0;
}

quand je compile, il n'y a pas de problème, par contre quand je l'execute A ne contient que des 0.00000 et si j'affiche a chaque tour de boucle gene1 j'ai toujours le premier element de ma ligne, alors que je m'attendrai au moins a voir le premier element...

Si quelqu'un peut m'aider
Si vous avez des remarque sur des améliorations de mon code, n'ésiter pas, je suis ici pour essayer de m'améliorer

merci

[homeostasie]

J'ai essayé pas mal de chose avec strtok, mais je n'y arrive pas.

Utiliser strtok() est une bonne solution mais son utilisation n'est pas correcte:
man developpez strtok()

Il est dit:

Le premier appel à strtok() doit fournir s comme premier argument. Les appels ultérieurs doivent fournir NULL comme premier argument. Chaque appel renvoie un pointeur sur l'élément lexical suivant, ou NULL quand il n'y en a plus.

D'autre part, atoi(), atof() etc... sont des fonctions obsolètes, il est préférable d'utiliser les fonctions strtoul(), strtod() etc...

[Melem]

strtok s'utilise en boucle si tu veux splitter une chaîne. Voici un exemple.

[Melem]

D'autre part, atoi(), atof() etc... sont des fonctions obsolètes

Je ne dirais pas de ces fonctions qu'elles soient obsolètes. Elles sont utiles dans certaines circonstances (pour tuer une mouche par exemple ...).

[solen]

super!
merci à vous 2, ca marche parfaitement maintenant

[solen]

Alors finallement, j'étais contente... mais j'ai encore un problème.

En fait, dans ma chaine de caractère que je veut découper, il y a les 2 premières colonnes qui ne sont pas des chiffres et que je ne veux donc pas stocker dans mon tableau. Je pensais faire un code tout bete :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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while (fgets(ligne,10000,file)!=NULL){
		j=0;
		gene1=strtok(ligne,"\t");
		gene1=strtok(NULL,"\t");
		while(gene1 != NULL){
			gene1 = strtok(NULL,"\t");
			A[j] = atof(gene1);	
			j=j+1;
		}
	}
 
	for(k=0;k<taille;k++){printf("%f\n",A[k]);}

Je pensais que j'allais ainsi écraser 3 fois le contenu de gene1 et stocker a partir de la 3eme fois dans mon tableau A.
Pourtant, quand je fais ma boucle pour afficher le contenu de A, je n'ai que des 0.000

Vous voyez pourquoi?
merci

[orfix]

Salut,

Peuts-tu poster le fichier que tu passes en argument ?

Apparemment atof aurais tendance à provoquer une erreur de segmentation si on lui passe un pointeur NULL, chose qui arrive avec ton code :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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while (fgets(ligne,10000,file)!=NULL){
		j=0;
		gene1=strtok(ligne,"\t");
		gene1=strtok(NULL,"\t");
		while(gene1 != NULL){
			gene1 = strtok(NULL,"\t");
			A[j] = atof(gene1);	
			j=j+1;
		}
	}
 
	for(k=0;k<taille;k++){printf("%f\n",A[k]);}

'gene1' peut très bien être NULL, ceci réglera le soucis :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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while (fgets(ligne,10000,file)!=NULL){
		j=0;
		gene1=strtok(ligne,"\t");
		gene1=strtok(NULL,"\t");
		while((gene1 = strtok(NULL,"\t"))!=NULL ){
			A[j] = atof(gene1);	
			j=j+1;
		}
	}
 
	for(k=0;k<taille;k++){printf("%f\n",A[k]);}