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Traitement d'images Discussion :

ouvrir des fichiers tif 3d


Sujet :

Traitement d'images

  1. #1
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    Par défaut ouvrir des fichiers tif 3d
    Bonjour,

    j'ai des images stockees sous format tif.
    j'essaye de les ouvrirs dans un programme pour obtenir la matrice 3d avec les valeurs des voxels.

    mon probleme est que le programme que j'utilise (IDL) ne prevoit que des tifs en 2d et donc quand je l'ouvre avec la fonction toute faite prevu pour, je n'obtiens que la premiere image (la premiere coupe)

    le logiciel a trouve tout seul l'information de la largeur et hauteur de l'image.

    je peux ouvrir ces images en 3d avec le logiciel imagej. le logiciel trouve tout seul toutes les informations, hauteur, largeur et nombre de coupe
    c'est pourquoi je pense que dans le fichiers, il est code qq part le nombre de coupe.
    si j'arrivais a editer le fichier tif, je verrais normalement comment sont inscrites toutes ces informations, et je pourrais alors en deduire un algorithme permettant de les lires automatiquement et d'enregistrer toutes les donnees dans une matrice 3d a la bonne taille, que je pourrais reutiliser apres dans mon programme.

    savez vous comment editer un fichier tif pour voir le codage, et comment sont notes les renseignements de l'image ?

    (les fichiers tif 3d sont appelles stack.tif )

  2. #2
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    Bonjour,

    cela n'a rien à voir avec de l'algorithmique.

    Mais pour ta réponse, quasiment n'importe quel éditeur de texte (à part word me semble t-il) peut ouvrir une image en fichier texte.
    Si tu as le bon goût de développer sous linux ou macosx, utilise ton IDE ou les bon vieux logiciels tels que : gEdit, nEdit, Kate, Joe, XCode, ...
    Si tu es sous window (comment peux t-on développer sur une palte-forme non stable) tente le bloc note.
    Consignes aux jeunes padawans : une image vaut 1000 mots !
    - Dans ton message respecter tu dois : les règles de rédaction et du forum, prévisualiser, relire et corriger TOUTES les FAUTES (frappes, sms, d'aurteaugrafe, mettre les ACCENTS et les BALISES) => ECRIRE clairement et en Français tu DOIS.
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  3. #3
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    je sais bien que ce n'est pas de l'algorithme mais je ne savais pas dans quel rubrique poster mon message

    sinon j'ai essaye pour editer l'image :
    sous windows : word, blocnot, et open offic writer et ca ne marche pas
    sous linux (sous lequel je developpe): kate et kwrite et ca ne marche pas non plus
    je vais telecharger ceux que tu m'as dis (s'ils sont en acces libre) et essayer
    merci pour l'info

  4. #4
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    alors pour gedit, il y a un probleme lors de l'installation
    il manque des informations necessaires a l'installation du logiciel sur ma station de travail

    et pour nedit, ca "marche", mais comme je comprend pas ce qui est a l'interieur du fichier ouvert, je sais pas si ca a vraiment marche

    ca me donne un truc du genre : (je tape quelques lignes a la main car bizarrement c'est impossible de copier les lignes de commandes, pour les mettres dans un autre programme pour les enregistrers en "texte", et quand j'enregistre avec nedit, ca enregistre en tant qu'image et donc j'ai la meme chose qu'au depart)

    II*<nul><bs><nul><soh><nul><so><enq><eot><ack><vt><gs><dc2> <cr><can><dle><si><vt><cr><si><cr> (ca c'est la 1ere ligne)
    <eot><ack><bs><cr> (ca c'est la 2eme ligne)

    ca continue comme ca tres longtemps

    et a la fin c'est
    ... <nul><nul><nul>(espace)<nul><nul><nul>(espace)<nul><nul><nul><nul><nul>H<nul><nul><nul><soh><nul><nul><nul>H<nul><nul><nul><soh>

    est-ce que c'est normal que j'obtiens ces truces etranges ?
    et comment je fais pour recuperer l'information (largeur, hauteur, nbredecoupe) pour pouvoir apres faire mon algorithme pour recuperer la matrice ?

  5. #5
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    a c'est bon, j'ai reussi a avoir ce que je voulais, j'ai decouvert la fonction d'idl qui me donnait tous les renseignements sur l'image (query_'typeimage')

    ca renvoit une structure avec tous les renseignements necessaire

    desole de vous avoir deranger pour pas grand chose

  6. #6
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    C'est bien d'avoir trouvé, mais je suis quand même étonné que les éditeurs n'arrivent pas à ouvrir une image en mode texte.
    Consignes aux jeunes padawans : une image vaut 1000 mots !
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    - ton poste tu dois marquer quand la bonne réponse tu as obtenu.

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