Discussion :

[soria_t]

Bonjour,

Je débute en programmation et je bute sur un petit problème.

J'aimerais savoir s'il est possible dans un fichier de connaître préalablement la taille des données que l'on va copier afin de les allouer dynamiquement (malloc?).
Le fichier comprend de nombreuses données et le problème est de pouvoir sélectionner à l'intérieur exactement ce que je veux .

Merci d'avance

[stephl]

Bonjour.
Si vous voulez parler de la taille totale du fichier, alors c'est possible (cf fseek et ftell).

[soria_t]

Non, justement.

Je crois que je me suis mal exprimée.
j'ai un fichier source dans lequels je n'ai besoin que d'une partie des informations. Ces informations peuventcorrespondres à 1% ou 90% du fichiers suivant le fichier que je traite.

La partie qui m'intéresse démarre toujours par une séquence connue, et comme je l'ai dit à une taille variable.
Elle peut faire 200 lignes comme 10 000. Voilà pourquoi j'ai besoin de savoir sa taille avant de démarrer mon programme.

Si quelqu'un a une idée pour m'aider, je suis preneuse.

[stephl]

Comment déterminez-vous la longueur de la partie qui vous intéresse? S'agit-il d'un fichier texte?

[souviron34]

vu l'exposé très flou du problème, les solutions seront floues...

Cependant, d'après le peu que l'on peut apercevoir, il faudra faire appel à des alloc, ou realloc.

Est-ce vraiment la TAILLE qui est inconnue, ou le NOMBRE ?

Qu'est-ce qu'une DONNEE ?

200 lignes ou 10 000 lignes c'est la taille de la donnée ou c'est le nombre ?

[Edit]
Emmanuel on l'a fait quasi en même temps
[/Edit]

[Emmanuel Delahaye]

J'aimerais savoir s'il est possible dans un fichier de connaître préalablement la taille des données que l'on va copier afin de les allouer dynamiquement (malloc?).

Si c'est un fichier binaire, oui avec fseek()/ftell(). Si c'est un fichier texte, ça va dépendre de l'implémentation.
Sinon, on sait agrandir un tableau à coup de realloc() ou alors stocker dans des structures de données souples comme une liste chainée...

Tout dépend de la structure du fichier... (texte, binaire, champs de taille fixes, variable...)

Le fichier comprend de nombreuses données et le problème est de pouvoir sélectionner à l'intérieur exactement ce que je veux .

Si le fichier est bien structuré, tu dois pouvoir faire ça sans avoir à le charger entièrement en mémoire... Il suffit de faire une lecture 'intelligente', c'est à dire en analysant les données pour y trouver le critère de recherche qui va bien...

Une solution tordue est souvent le résultat d'un problème mal posé. Que veux-tu faire exactement ? Quelle est la structure du fichier ?

EDIT :

j'ai un fichier source dans lequels je n'ai besoin que d'une partie des informations.

Quel est le critère de recherche ?

Ces informations peuventcorrespondres à 1% ou 90% du fichiers suivant le fichier que je traite.

Comment est déterminé la longueur de ces informations ?

La partie qui m'intéresse démarre toujours par une séquence connue,

OK, ça répond à une de mes question

et comme je l'ai dit à une taille variable.
Elle peut faire 200 lignes comme 10 000.

Et ça, ça confirme ma 2ème question.

Voilà pourquoi j'ai besoin de savoir sa taille avant de démarrer mon programme.

Là, par contre, je ne vois pas le rapport.

[soria_t]

Ces fichiers sont relativements bien structurés et comme je le disais, je connais la séquence de début des données qui m'intéresse. C'est comment le lire d'une façon intelligente qui pose problème.

Je voulais essayer une boucle do while, mais je ne sais pas comment mettre un critère de début avant le décompte

Merci de vos réponse.

[stephl]

Comment savez-vous jusqu'où lire dans le fichier?

[soria_t]

Argghhh

je ne suis pas claire.
Dans une séquence de protéine, le nombre d'atome est fixe mais ici je travaille sur des protéines de tailles différentes et donc qui peuvent être très différentes.

Les données qui changent d'une protéines à l'autres c'est le nombres d'atomes, et tous ce qui les qualifie.
Par bonheur chaque atome et ce qui le qualifie (coordonnées...) commence par la séquence ATOM.

Ma question : comment transformer mon programme qui utilise un tableau statique en programme utilisant un tableau dynamique ? Il me semblait que pour ça ,il faut connaître le nombre d'atomes.

[Emmanuel Delahaye]

je ne suis pas claire.

Ce serait beaucoup plus clair si tu postais un exemple de fichier (espérons que ce soit du texte) et un exemple de ce que tu veux extraire...

[stephl]

Si j'ai bien compris, un fichier représente une molécule. Un fichier est composé de blocs de données de taille variable représentant chacun un atome, c'est cela?
Dans ce cas, si le nombre d'atomes n'est pas précisé au début du fichier, je ne pense pas qu'il soit possible de déterminer le nombre d'atomes sans avoir lu l'intégralité du fichier. Cependant, j'ai du mal à saisir le problème que cela engendre.

[soria_t]

alors voici un exemple de fichiers et surtout des informations que je recherche.
Bon le serveur n'aime pas les fichiers en .pdb, je l'ai donc mis en .c
Là-dedans ce qui m'intéresse est la parties atome et tous ses composants. (Je crois qu'il n'y a pas de problème pour lire le format pdb)
Chaque atome est sur une ligne.

Et d'un fichier à l'autre, on n'a pas le même nombre d'atomes. J'ai besoin de stocker les données dans un tableau de taille adapté. D'où malloc qui me demande le nombre d'atomes au départ.

Ais-je été plus clair ?

Merci beaucoup,
human_trail.c