Discussion :

[Dorhub]

Bonjour,

Je souhaiterais faire un grep de ce motif :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 H4' FAD     3

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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ATOM    207  C4' FAD     3     -10,050 
ATOM    208  H4' FAD     3     -11,163 
ATOM    209  O4' FAD     3      -9,663
ATOM    210 HO4' FAD     3      -9,114
ATOM    211  C5' FAD     3      -9,586 
ATOM    212  HO  FAD     3      -9,557

Cependant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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3
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7
 
grep ""H4\' FAD     3"" texte.txt
grep ""FAD     3"" texte.txt
grep ""FAD\ \ \ \ \3"" texte.txt
grep "FAD\ \ \ \ \3" texte.txt
grep -E -i (H4\'|FAD|3) texte.txt
grep -E -i '(H4\'|FAD|3)' texte.txt

Ne marche pas, est ce que quelqu'un aurait une idée ??

Bonne journée !

[Flodelarab]

Bonjour

Généralement, on protège le motif de grep par des simple quotes, pas des double quotes, pour éviter toute interprétation involontaire.

Ensuite, quelle est la nature des espaces entre tes textes ? Si ce sont des tabulations, ton motif est mal décrit. Pense à [:space:].

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

od -c fichier.txt

Enfin, rentrer dans un double quote pour en sortir immédiatement ne sert à rien. Le reste n'est pas protégé.

[Flodelarab]

PS :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ grep "H4' FAD     3" fichier.txt 
ATOM    208  H4' FAD     3     -11,163

[disedorgue]

Généralement, on protège le motif de grep par des simple quotes, pas des double quotes, pour éviter toute interprétation involontaire.

PS :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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2
$ grep "H4' FAD     3" fichier.txt 
ATOM    208  H4' FAD     3     -11,163

J'aime beaucoup

[N_BaH]

[Dorhub]

Cela ne marche pas car il y a une apostrophe après le 4, est des espace entre le D et le 3 .

Si je met 3 apostrophes sur la meme ligne cela ne marche pas non plus

[N_BaH]

il faut protéger l'apostrophe en dehors des paires d'apostrophes :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

grep 'H4'\''\s\+FAD\s\+3' fichier.txt

[Dorhub]

Merci !