Discussion :

[Mzriu]

Bonjour !

J'ai un problème pour récupérer des données dans un .txt. Un logiciel de simulation me permet de voir les caractéristiques d'un proton ayant traversé de la matière et exporte ces données dans un .txt de la forme suivante : (je ne peux pas modifier la manière dont le logiciel exporte les données)

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Plusieurs lignes de texte qui décrit les colonnes 
bla bla
bla bla
bla bla
 
 Ion     Atom   Energy          Depth       Lateral-Position        Atom Direction      
 Numb Numb    (eV)             X(A)        Y(A)       Z(A)      Cos(X)  Cos(Y) Cos(Z) 
T    1    1   ,1923876E+08   5000022E-01 -,3546E+04  ,2804E+03   ,9999656 -,0082181  ,0011361
T    2    1   ,1916511E+08   5000022E-01  ,5368E+04  ,1542E+04   ,9996267  ,0247368  ,0116009
T    3    1   ,1927306E+08   5000023E-01 -,2016E+04  ,8875E+03   ,9998685 -,0119370  ,0109733
et pleins d'autres lignes du même genre

Il me faudrait récupérer les données dans la colonne "Energy (eV)" qui contient les éléments ",192...E+08". En fait ce nombre est égal à 1.92...E+07.
C'est là tout mon problème, le fichier ici n'est vraiment pas simple en terme de séparateurs (il y a des espaces et des virgules)... Je n'arrive pas à écrire un code qui puissent me permettre de récupérer les différentes valeurs d'énergie et à les exporter sous la forme 1.92...E+07 dans un autre fichier .txt

Merci d'avance si vous avez une astuce !

[wiztricks]

Salut,

Merci d'avance si vous avez une astuce !

C'est un fichier texte, donc une suite de lignes.

La première chose à faire est de récupérer les lignes qui contiennent les données numériques, soit le nombre de lignes à sauter est connu, soit en repérant la ligne qui commence par 'Ion'.
Ce qui fait un premier "filtre" qui récupère une liste de lignes.

Après on s'occupe de chaque ligne.
Il faut vous préoccuper du sens de vos données, si ' ' est un séparateur, les ',' sont peut être des '.' i.e. le séparateur des parties entières et décimales d'un nombre.
Dans ce cas, ils ne séparent pas des champs mais en font partie...

- W

[Mzriu]

Merci pour votre réponse. J'ai réussi à filtrer la première partie contenant le texte. J'ai donc un fichier .txt uniquement composé de ligne comme :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

T    1  1 ,1923876E+08   5000022E-01 -,3546E+04  ,2804E+03   ,9999656 -,0082181  ,0011361

Et c'est là que je galère... En fait j'utilise np.genfromtxt pour ouvrir ce fichier que je viens de créer et je veux créer une liste d'énergie contenant toutes mes énergies.
J'écris alors le code suivant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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    dataEn = np.genfromtxt('dataTRIM.txt') 
    energy = dataEn[:,3]

Le soucis c'est cette virgule. Avec genfromtxt j'arrive à extraire des nombres de la forme 1.1545E+08 (un point pour séparer l'unité des décimales) par exemple. Mais là, avoir: ,192...E+08 au lieu de 0.192...E+08 ou bien 1.92...E+07 induit une erreur "nan : not a number" dans chaque élément de ma liste "energy".

Comment puis-je procéder à partir de là ?

[wiztricks]

Comment puis-je procéder à partir de là ?

Si c'est les ',' qui vous embêtent, vous les remplacez par des '.'.

- W

[danielhagnoul]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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[...]
 
 Ion     Atom   Energy          Depth       Lateral-Position        Atom Direction      
 Numb Numb    (eV)             X(A)        Y(A)       Z(A)      Cos(X)  Cos(Y) Cos(Z) 
T    1    1   ,1923876E+08   5000022E-01 -,3546E+04  ,2804E+03   ,9999656 -,0082181  ,0011361
T    2    1   ,1916511E+08   5000022E-01  ,5368E+04  ,1542E+04   ,9996267  ,0247368  ,0116009
T    3    1   ,1927306E+08   5000023E-01 -,2016E+04  ,8875E+03   ,9998685 -,0119370  ,0109733
 
et pleins d'autres lignes du même genre

Il me faudrait récupérer les données dans la colonne "Energy (eV)" qui contient les éléments ",192...E+08". En fait ce nombre est égal à 1.92...E+07. [...]

Merci d'avance si vous avez une astuce !

Je ne crois pas que le 1 fasse partie de l'élément (ev)

     Numb Numb    (eV)             X(A)        Y(A)       Z(A)      Cos(X)  Cos(Y) Cos(Z) 
T    1    1   ,1923876E+08   5000022E-01 -,3546E+04  ,2804E+03   ,9999656 -,0082181  ,0011361

[Mzriu]

C'est bon j'ai réussi à me débrouiller !

Merci pour vos réponses

[Sve@r]

Bonjour

C'est bon j'ai réussi à me débrouiller !

https://sebsauvage.net/wiki/doku.php?id=csv