Discussion :

[irishupk]

Bonjour,

Je souhaiterai modifier tous les caractères . contenus dans la colonne 5 par jvb.
Mais je ne sais as comment spécifier au terminal que je parle du caractère . et non du . qui signifie n'importe quel caractère

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk '{ $5=gensub(".","jvb","G",$5) ; print  }' essai_id.vcf > essai_id-2.vcf

j'ai déjà essayé sans succès :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk '{ $5=gensub("\.","jvb","G",$5) ; print  }' essai_id.vcf > essai_id-2.vcf

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk '{ $5=gensub(""."","jvb","G",$5) ; print  }' essai_id.vcf > essai_id-2.vcf

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk '{ $5=gensub("\.\","jvb","G",$5) ; print  }' essai_id.vcf > essai_id-2.vcf

Merci

[BufferBob]

salut,

je ne sais as comment spécifier au terminal que je parle du caractère . et non du . qui signifie n'importe quel caractère

il faut échapper le caractère, éventuellement en doublant l'échappement si besoin (et gensub est superflu ici) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
$ awk '{gsub(/\./, "jvb", $5); print}' <<< "1 2 3 4 5_._._.__ 6 7"
1 2 3 4 5_jvb_jvb_jvb__ 6 7
$ awk '{gsub("\\.", "jvb", $5); print}' <<< "1 2 3 4 5_._._.__ 6 7"
1 2 3 4 5_jvb_jvb_jvb__ 6 7

(donc soit /regex/ et on échappe simple, soit "regex" et il faut effectuer un échappement double)

[irishupk]

Merci de votre aide ! ça marche super et c'est exactement ce que je voulais ! Merci !