Discussion :

[benoit3166]

Bonjour à tous,

J'ai un data frame ayant pour dimension: 5026 45.

Voici un petit exemple fictif de mon dataframe:


Sample1 Sample2
PF32 14 -3
PF23 -5 12
PF45 9 9
PF89 0 4

Comme je l'ai écris dans le titre, je cherche à récupérer les 50 meilleures (plus grande) valeurs de Sample1, puis de Sample2, etc ... Tout en gardant le nom des rangées (PF32 par ex).

J'ai essayé :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

sort(data$Sample1, decreasing = TRUE)

Seulement, cela me renvoie une liste sans associer le nom des rangées.

Avez vous une idée de comment procéder ?

Merci !

[xavier-Pierre]

bonjour , une solution avec le tidyverse

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
 
library(tidyverse)
data <- rownames_to_column(data,'nom_explicite')## on transforme les valeurs de rangées en une colonne nommée, je te laisse choisir un nom plus adapté
 
##ex pour  Sample1 
data_sample1<- data %>% arrange(desc(Sample1)) %>% ## on classe par ordre décroissant
 slice(1:50)%>% ## on sélectionne les 50 premières lignes (les plus hautes)
select(nom_explicite,Sample1) ## on sélectionne éventuellement les 2 colonnes
 
## idem pour pour Sample2

[benoit3166]

Super, ça marche. Merci beaucoup Xavier-Pierre.