Discussion :

[mido1951]

bonjour,

je cherche une fonction ou méthode prédéfinie (je ne sais pas si elle existe ou non) qui retourne les positions d'une sous chaine dans une autre longue?
par exemple:

seq: AGCTGTTCGATCGAATCGTGTTCGATTTTCGACTGTGTTCGAACTCGATGTGTTCGACATCAGCTACGCGT
motf: TGTTCGA
Il retourne les position suivante: 4, 19, 36, 51.
Comme on peut trouver une seul position.

est-ce que ça existe?
sinon est-ce que vous avez une idée comment faire?
Merci

[ternel]

strstr, je crois

[mido1951]

strstr, je crois

strstr retourne la première occurence et non pas une position.

[picodev]

Bonjour,
lis bien la doc … strstr retourne un pointeur dans la chaîne pour indiquer où se trouve la première occurence. si tu recommences dans la même chaîne après la première occurence tu trouves les autres. → strstr + boucle

[mido1951]

voici le retour de strstr(). d'abord le retour est un char*.
donc pour mon exemple:
seq: AGCTGTTCGATCGAATCGTGTTCGATTTTCGACTGTGTTCGAACTCGATGTGTTCGACATCAGCTACGCGT
motf: TGTTCGA

elle retourne: TGTTCGATCGAATCGTGTTCGATTTTCGACTGTGTTCGAACTCGATGTGTTCGACATCAGCTACGCGT

ce n'est pas une position c'est une chaine de caractère.

[picodev]

char * est … un pointeur dans la chaîne où on cherche … et avec l'arithmétique des pointeurs on fait ce genre de chose :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#include <stdio.h>
#include <string.h>
 
int main(void)
{
  char foin[]="il n'est pas difficile de trouver une aiguille ou des aiguilles dans une botte d'aiguille";
  char aiguille[]="aiguille";
 
 
  printf("positions = ");
  char *position=foin;
  do {
    position=strstr(position, aiguille);
    if (position==NULL)
      puts("");
    else  {
      printf("%td ", position-foin);
      position=position+1;
    }
  } while(position!=NULL);
 
  return 0;
}

[jopopmk]

Salut,

une boucle avec strstr me paraît pas mal.