Bonjour,

je cherche un moyen d'obtenir des informations sur mes snp en ne connaissant QUE la position
Pas le NOM/ID/AssessionNB ou quoi que soit d'autre. Juste chr1:123456
Avec cela, j'aimerai connaître au moins:
- le nom du gene (SYMBOL HUGO de preference), ou sinon un quelconque id qui pourrait être converti
- la localisation (intronique, exonique, UTR, ...)
- le transcrit

Essentiellement, il me faudrait quelque chose comme:
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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ma_fonction(c("chr1:6528589", "chr1:6529443", "chr1:6529807", "chr1:6529823", "chr1:6530189", "chr1:6530435", "chr1:6530965"))
#donnant en résultat:
chr1:6528589     exon     PLEKHG5     ENST1454541545
chr1:6528589     exon     PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6528589     exon     PLEKHG5     ENST1878978799
chr1:6529443     exon     PLEKHG5     ENST1454555555
chr1:6529443     exon     PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6529443     exon     PLEKHG5     ENST1878978799
chr1:6529807     intron   PLEKHG5     ENST1454541545
chr1:6529807     intron   PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6529807     intron   PLEKHG5     ENST1878978799
chr1:6529823     exon     PLEKHG5     ENST1454541545
chr1:6529823     exon     PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6529823     exon     PLEKHG5     ENST1878978799
chr1:6530189     3UTR     PLEKHG5     ENST1454541545
chr1:6530189     3UTR     PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6530189     3UTR     PLEKHG5     ENST1878978799
chr1:6530435     exon     PLEKHG5     ENST1454541545
chr1:6530435     exon     PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6530435     exon     PLEKHG5     ENST1878978799
chr1:6530965     exon     PLEKHG5     ENST1454541545
chr1:6530965     exon     PLEKHG5     ENST0012313121
chr1:6530965     exon     PLEKHG5     ENST1878978799
Quelqu'un aurai une piste?

Merci!