À l'exception de tempdb, les bases système dont très petites et peu utilisées d'un point de vue stockage. Donc elles peuvent rester sur le disque système.
Pour tempdb c'est différent. Si elle est fortement sollicité, la mettre sur un ou plusieurs disques physiques différents de tous les autres. Pour des raisons de perf, il est aussi conseillé de créer plusieurs fichiers pour la gestion du parallélisme. par exemple si vous avez 32 cœurs et avez limité le parallélisme à 4, alors vous devriez créer 4 fichiers de données pour la tempdb et placer son JT sur un disque mécaniquement distinct et totalement indépendant des autres bases.
Pensez aussi à dimensionner correctement vos fichiers pour une exploitation de 3 à 5 ans afin de ne jamais avoir d'opérations de croissance.
Enfin, si vous êtes en cluster système, il est possible de placer la tempdb de manière locale pour en augmenter les performances, les SAN étant généralement très contre performant pour les SGBDR, lorsqu'ils sont partagés...
Vous en saurez plus dans mon livre dont un chapitre de plus de 70 pages est consacré au stockage :
http://www.amazon.fr/SQL-Server-2014.../dp/2212135920
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