Discussion :

[Jasmine80]

Dans la FAQ, il y a un an, Djibril a écrit

D'un point de vue personnel, je recommande d'installer la version 5.12 car on a plus de facilités pour trouver des modules CPAN compatibles (Sous Windows via ppm).

... est-ce toujours d'actualité? En bioinformatique plus particulièrement, quelle version perl conseillez-vous à ce jour?


D'avance merci,

[Philou67430]

De cette phrase me vient une réflexion : comment sont gérées les compatibilités modules vs perl ? (j'avais en tête que dès lors qu'un module est compatible avec une version de perl5, il l'est forcément avec les versions ultérieures ... je me trompe ?)

[Jasmine80]

J'ai installé la version 5.12, Activestate sous windows 7


mon programme (utilisé avec l'éditeur Scite) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
#!/usr/local/bin/perl
 
 
use strict;
use warnings;

le message d'erreur

>Le fichier spécifié est introuvable.

perl est bien installé, confirmation par (perl -v) ... ça doit être un problème du $path ... pourriez-vous m'aider svp?


Merci,

[Jasmine80]

j'ai installé via ppm les repositories suivants :

name : bioperl1
location : http://bioperl.org/DIST/package.xml

name : bioperl2
location : http://bioperl.org/DIST/RC


... avec celui d'Activestate par défaut, ça m'en fait 3 ... quels autres me conseilleriez-vous?


EDIT :
Je viens de trouver la réponse dans un ancien message de Djibril (une fois de plus merci à lui) :

1) Tu vire le repository activestate
2) tu mets ça :
trouchelle_active
http://trouchelle.com/ppm/activestate/820/

3) Ajoute :
trouchelle
http://trouchelle.com/ppm/

theoryx
http://theoryx5.uwinnipeg.ca/ppms/

bribes
http://www.bribes.org/perl/ppm

bioperl1
http://bioperl.org/DIST/package.xml

bioperl2
http://bioperl.org/DIST/RC/

[Philou67430]

Euh... sous Windows, tu peux utiliser le shebang avec des chemins Unix ?

[Jasmine80]

J'ai utilisé ce que Djibril m'avait conseillé à mes débuts perl et ça n'a jamais posé de problèmes. J'étais sur XP, je viens d'acquérir un nouveau PC sous windows 7. Je dois tout réinstaller.

[Jasmine80]

Je viens de lire dans mon bouquin Learning Perl

On non-Unix system, it's traditional (and even useful) to make the first line say #!perl. If nothing else, it tells your maintenance programmer as soon as he or she gets ready to fix it that it's a Perl program.

If that #! line is wrong, you'll generallt get an error from your shell. This may be something unexpected like 'file nit found'... it's /usr/bin/perl that wasn't where it should have been.

je vais y regarder de plus prêt, merci Philou pour cette piste ... mais ça a toujours fonctionné sur mon ancien windows xp!

[Philou67430]

Ah ... tiens, je vais bientot faire la même migration. Pour ma part, j'ai toujours opté pour la solution Cygwin... qui me rapproche de l'usage privé que j'ai sous Linux (je ne t'invite pas à passer à Cygwin bien sur), et qui surtout, me rend tous mes outils Unix dispo sous MS.