Bonjour,
je veux faire un test de Student sur mes données qui sont organisées comme suit :
Sequence -- A -- B
seq1 -- 2.3 -- 3.2
seq1 -- 1 -- 0.9
seq1 -- 0.2 -- 0
seq2 -- 5 -- 6
seq2 -- 2.3 -- 2
seq2 -- 3 -- 3.2
...
Je veux faire le test de Student entre mes valeurs de A et B pour chaque séquence.
Je le fais avec PERL et R integré, mais c'est très très long, car je divise mon long fichier en d'autres petits fichiers que je donne à R à chaque fois, pour avoir la p-value.
Je lis mon long fichier de milliers de lignes et à chaque fois je mets les trois lignes d'une séquence et je passe ce fichier à R.
Savez-vous comment faire avec R pour que je puisse faire tout d'un coup ?
Merci d'avance
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