Discussion :

[Décembre]

Bonjour,

j'ai un ensemble de vues coronales 2D d'un objet 3D que j'essaie de transformer en vues axiales. Des logiciels permettent de le faire mais ils imposent toujours un format de sortie spécifique. alors je me plonge dans le problème et je vais essayer de coder quelque chose. J'espère juste pouvoir y arriver.

Pouvez-vous m'orienter un peu?

merci d'avance

[Obsidian]

Certainement. Ça devrait même ne pas être trop difficile mais peux-tu toutefois nous donner un exemple concret de ce que tu cherches à faire, et des logiciels que tu as déjà utilisés, ce afin que l'on t'oriente vers le langage le plus adapté si besoin ?

[Décembre]

Merci,

j'ai 200 images dicoms de vues coronales, avec imageJ j'ouvre cette séquence d'images puis je fais un reslice (flip vertically) et j'obtiens une nouvelle séquence de vues axiales. malheureusement imageJ ne permet pas de sauvegarder les images au format dicom c'est ce qui m'oblige à trouver le moyen de le faire.

Encore merci

[Obsidian]

J'imagine que, par là, tu veux dire que tu génères des vues complètement nouvelles en interpolant les infos de différents clichés, pour obtenir un nouvel angle de vue comme si les photos avaient été prises depuis cet angle.

Parce que si ce que tu cherches à faire, c'est un simple renversement vertical, alors il existe une flopée de logiciels qui sont capables de le faire et qui prennent en charge le DICOM.

Quoiqu'il en soit, le plus simple dans un premier temps, si tes transformations sont compliquées, est d'utiliser ton logiciel pour les faire, puis reconvertir le fichier de sortie vers le DICOM à l'aide d'un logiciel-tiers.

Tu peux utiliser des logiciels tel qu'ImageMagick pour faire des conversions à la volée de grands nombres de fichiers graphiques à la fois.

[Décembre]

Bonjour,

Parce que si ce que tu cherches à faire, c'est un simple renversement vertical, alors il existe une flopée de logiciels qui sont capables de le faire et qui prennent en charge le DICOM.

c'est exactement ce que je cherche à faire, pouvez-vous m'expliquer le principe du renversement vertical d'images ?

merci d'avance,

[Obsidian]

Bonjour,

c'est exactement ce que je cherche à faire, pouvez-vous m'expliquer le principe du renversement vertical d'images ?

On s'est mal compris, apparemment, désolé. Je disais « parce que si ce que tu cherches à faire… ». Il y a un fil qui vient tout juste d'être posté dans le forum algo concernant un problème similaire : http://www.developpez.net/forums/d95...n-3d-vertebre/

Quel format de sortie ton logiciel t'impose-t-il ?

[Jerome Briot]

malheureusement imageJ ne permet pas de sauvegarder les images au format dicom c'est ce qui m'oblige à trouver le moyen de le faire.

Je n'utilise pas ImageJ mais il y a quelques plugins qui semblent prendre en charge les fichiers DICOM en lecture/écriture : FAQ: Which file formats are supported by ImageJ

Maintenant, il faut aussi savoir si, au final, tu veux obtenir des fichiers au format DICOM ou des fichiers conforme à la norme de communication DICOM (identifiant unique...)

Que comptes-tu faire avec les nouveaux fichiers DICOM ?

Je me permet de rappeler que DICOM n'est pas qu'un format d'image, c'est surtout une norme de transfert de données médicales