Discussion :

[asty69]

Bonjour

j aimerai savoir s'il est possible de faire traiter tous les fichiers d un dossier via python
et d en faire sortir qu' un seule

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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fichier_1=open("mon_fichier_1.txt")
fichier_2=open("mon_fichier_2.txt")
contenu_1=fichier_1.read()
contenu_2=fichier_2.read()
fichier_sortie=open("mon_fichier_sortie.txt","w") # ouverture en écriture du fichier résultat
fichier_sortie.write(contenu_1 + contenu_2)
fichier_sortie.close()
 
# version 2
open("mon_fichier_sortie.txt","w").write(open("mon_fichier_1.txt").read() + open("mon_fichier_2.txt").read())

J ai deja exploré des piste pour la sorti je recupere tous les fichier de sorti et je les fusionne.
Mais le probleme c est que dans mon bout de code le nombre de fichier est connu, comment faire qd le nombre est inconu.

Quand a l entré j ai aucune idée

merci pour votre aide

[kango]

bonjour,

par exemple comme ça:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import glob
fichier_sortie = open('mon_fichier_sortie.txt','w')
for f in glob.glob('*.txt')
    data = open(f,'r').read()
    fichier_sortie.write(data)
fichier_sortie.close()

j'ai aps testé, mais ça doit pas être trop loin.

[Zavonen]

Ce que tu veux faire c'est de la concaténation de fichier.
Le problème avec les instructions du genre:
data = open(f,'r').read()
C'est que quand on a affaire à de gros fichiers on peut saturer la mémoire.
Aller voir par exemple cette page:
http://stackoverflow.com/questions/1...iles-in-python

[kango]

oui oui, tout à fait, mon bout de code ne s'applique qu'à des fichiers de taille raisonnable

[asty69]

Merci de votre aide

pour l'entree j ai pas trouver de solution

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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root = Tkinter.Tk()
import Tkinter
import tkFileDialog
import os
 
from tkFileDialog import askopenfilename
Fichier_a_traiter = askopenfilename(filetypes = [("All", "*"),("Selection du fichier a traiter","*.fa")])
 
 
commands.getstatusoutput('/home/m1sp/bin/decoup_CpG '+ Fichier_a_traiter + ' arbre Fichier_a_traiter.out 3 0.4 2.65 1.5 8.8 1.66')

ce bout de code marche bien
il me permet de selection un fichier et de le traiter via la commands.getstatusoutput par un un programme et obtenir le resultat dans un fichier de sorti

le probleme c est ' du manuel' je choisi un fichier parmi 8000 dans un dossier

et j aimerai traiter les 8000 fichier sans a voir a les selectionner manuellement

d'ou ma premiere question:
est ce possible
si oui comment

[kango]

bonjour,

d'ou ma premiere question:
est ce possible
si oui comment

tu as pas dû lire ma réponse...
un indice tout de même: glob.

[Zavonen]

Certainement tu n'as pas lu la réponse de Kango qui marche parfaitement pour des fichiers de taille raisonnable, ni visité le site que je te recommande.

[asty69]

si j ai bien compris vos code et message
mais il serve surtout a "fusioner" les fichier

mais pour faire traiter un a un fichier qui se trouve dans un dossier
on fait comment
on m a dit supprimer l interface graphique car ca compliquait la chose
mais je ne vois tjs pas comment on fait
meme avec glob
vous aurez un exemple

[kango]

et bien, la fonction glob.glob de mon code te renvoie une liste de tous les fichiers .txt du répertoire courant.

je ne vois pas ce qu'il te faut de plus, une fois que tu as une liste des noms, il n'y a plus qu'à itérer sur la liste pour faire les opérations sur les fichiers.