Discussion :

[Yoshipot]

Bonsoir,

Je viens de passer 8 bonnes heures à écrire des batch et macro dans imageJ afin de traiter des piles d'images. Mais aucune solution ne semble marcher.

J'arrive à traiter une image à la fois (passer en nuance de gris, postériser les couleur d'une image...) mais le vrai problème reste cette pile d'images!

J'ai 20 piles (stacks) d'environ 1800 images (slices) à traiter... Le image par image me semble trop titanesque...



Quelqu'un aurait-il une macro ou un batch qui fonctionne sur imageJ? (peut importe la fonction, le process ou le plugin employé... tant que la séquence de destination a subis un traitement)

MERCI D'AVANCE

[Yoshipot]

Finalement la 9ème heure a porté ses fruits...

Pour ceux qui ont rencontré ce problème voici une solution (ce n'est sans doute pas la seule)

En faisant une macro au format .txt qui appel les plugins au format *.class et dont le nom se termine par un underscore (_) ca marche plutôt bien...

Donc je charge une Image Sequence,

Je run la macro dont voici le code:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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// Cet outils permet d'appliquer ma suite de plugin sur n images
 
        macro "TranscrptionEnIntensite" {
        requires("1.31l");
        if (nSlices==1)
            exit("This tool requires a stack");
 
 
 
        for (z=0; z<nSlices; z++) {
     		run("RedressColor2 ");
     		run("NormalizColor2 ");
     		run("Mean...", "radius=15");
     		run("Intensite ");
		run("RedressColor2 ");     		      	
     		run("Next Slice [>]");
        }
        for (z=0; z<nSlices; z++) {       	
			run("Previous Slice [<]");
        }
 
 
    }

Et je save as en Image séquence au format choisi...

ImageJ est puissant, et sais quasiment faire tout type de traitement sur les images... Mais en ayant 1Million de possibilités, il est très difficile de trouver la bonne solution.

Merci quand même aux 20 qui ont lu la question en voulant me trouver une réponse