Discussion :

[PicuiPicui]

Bonjour à tous,

Pour un projet, je dois créer une base de données en MySQL ainsi qu'une intreface web d'interrogation.
Pour une requête, je dois créer un graphique sous R.

Dans mon cgi, j'ai donc un script perl qui exécute les différentes requêtes de mon interface Web. La création du graphique se déroule en 3 parties :
* Création du fichier contenant les données
* Création d'un script contenant les commandes R
* Exécution du script sous R
Le problème se présente au niveau de cette dernière étape :
j'utilise sous perl ceci : `R CMD BATCH script.r script.out`
en ayant auparavant gérer tous les problèmes de droits avec la commande bash `chmod`.

Le fichier graphique n'est pas généré et je peux lire cette erreur dans le fichier script.out :
/usr/lib/R/bin/exec/R: symbol lookup error: /usr/lib/R/lib/libR.so: undefined symbol: gzopen64

Si j'exécute la même commande directement avec ma console, le graphique est bien généré. Je suppose qu'il y a un problème de compatibilité entre R et Xampp.

Quelqu'un a t'il une idée pour résoudre cette erreur???
Merci à vous
Picui

[Ayest]

Bonjour,

Essaie d'ajouter les options '--vanilla --slave' lorsque tu appelles R.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
R --vanilla --slave CMD BATCH test.R

[PicuiPicui]

J'ai essayé mais çà ne marche pas non plus l'ajout de ces options!

[Ayest]

Ah. Alors je ne vois pas trop. Désolé. Une piste peut-être dans le lien suivant (c'est du php, mais tu devrais pouvoir l'adapter sans problème en perl) :

http://www.math.ncu.edu.tw/~chenwc/R...p&subitem=ex_2

Tiens nous au courant, c'est intéressant.

[slayercode]

Salut,
J'ai reussi a resoudre ce probleme sous ubuntu 9.10
D'abord, je pense que le probleme vient d'apache qui est installé dans lampp, peut etre qu'il faut le configurer avant de l'installer pour pouvoir executer des scripts R a partir d'un script php.
La solution est que j'ai virer lampp et que j'ai installé apache et php manuellement a partir de leurs codes source.

J'espere que sa vous aide.