Discussion :

[tom77380]

Bonjour,

je dispose d'un fichier CVS dont j'aimerai modifier une colonne, cette colonne contient des numéros précédés d'une chaine de caractère : "num".
J'aimerai modifier ce fichier de façon a éffacer "num" et a ne garder que le nombre qui suit.

Je n'ai jamais modifier de fichier via Python, mon script semble un peu fouilli...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import csv             # j'importe le module csv
 
fichier = open('test.csv','rb')          #j'ouvre mon fichier
fichiercsv = csv.reader(fichier, delimiter=' ')          #je le lis
 
for ligne in fichiercsv:                          # enfin je boucle et je remplace les "num" par rien
 
     csv.replace("num", "")
 
fichier.close()                      #je ferme le fichier

Biensur ce code ne fonctionne pas, plus étonnant j'obtiens une erreur dès la 1ere ligne,
"import : commande introubable".

Merci à vous

[tyrtamos]

Bonjour,

Dans la boucle 'for', ligne est la liste des champs de l'enregistrement. Le remplacement ne peut se faire que sur l'un des champs. Par exemple, si c'est le 3e champ (=indice 2):

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for ligne in fichiercsv:
    ligne[2]=ligne[2].replace("num", "")

[tom77380]

Bonjour,

merci pour votre réponse,

j'ai modifié mon code comme vous me l'avez suggéré, cependant j'aimerai appliqué cette modification à l'ensemble des lignes de mon fichier, j'avais donc pensé a ça :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for ligne in fichiercsv:
 
	ligne = ligne.replace("num","")

mais j'obtiens le message d'erreur suivant ;

AttributeError: 'list' object has no attribute 'replace'

Je dois reconnaître que je ne comprends pas tout, cela signifie que je ne peux pas appliquer la fonction replace sur mon indice ligne ?

[tyrtamos]

- replace est une méthode qui s'applique à une chaine de caractères

- ligne est ici une liste de chaines et non une chaine: ligne.replace génère donc une erreur!

- ligne[2], par contre est une chaine: c'est le 3e élément de la liste "ligne".

Pour appliquer le remplacement à toutes les lignes et retrouver le résultat après la boucle, il faut récupérer le résultat de chaque ligne dans une nouvelle liste:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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listecsv = []
for ligne in fichiercsv:
    ligne[2]=ligne[2].replace("num", "")
    listecsv.append(ligne)
# ici, listecsv contient toutes les lignes après application du remplacement

Ce serait bien de passer un peu de temps avec le cours de Gérard Swinnen: http://python.developpez.com/cours/TutoSwinnen/ .

[tom77380]

Merci pour votre réponse je comprends mieux, je vais étudier attentivement ce tutoriel.

[tom77380]

J'aurais juste une dernière question

Lorsque je test ce code j'ai le message d'erreur suivant ;

IndexError: list index out of range

j'ai déjà vu ce message d'erreur lorsque je tentais de faire rentrer X données dans un tableau avant seulement X-1 places, mais ici ce n'est pas le cas, je n'ai pas de taille pré défini :/

[mont29]

Cela signifie probablement que le CSV n’a qu’une ou deux colonnes…

La ligne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

ligne[2]=ligne[2].replace("num", "")

… implique que chaque ligne du CSV est formée d’au moins trois colonnes, puisqu’elle travaille sur la troisième colonne. Il faut adapter l’indice (le 2) à la colonne à laquelle se trouvent les données à traiter.

[afranck64]

Une fois le remplacement en mémoire effectué, vous devez faire la sauvegarde sur disque.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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out = open("genes_edit.csv", "wb")
outw = csv.writer(out)
outw.writerows(listecsv)
out.close()

Tête en l'air...

[tom77380]

Merci pour vos réponses,

j'avais en effet un soucis d'indice (merci mont29), par contre pour la sauvegarde sur le disque je suis un peu perdu, j'ai testé le code suivant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import csv
 
fichier = open('test.csv','rb')
fichiercsv = csv.reader(fichier, delimiter=',')
out = open("test_edit.csv", "wb")
outw = csv.writer(out)
outw.writelines(listecsv)
listecsv = []
for ligne in fichiercsv:
 
	ligne[0] = ligne[0].replace("chr","tot")
	listecsv.append(ligne)
 
 
 
out.close()   
fichier.close()

mais j'obtiens le message d'erreur suivant en console :

File "script.py", line 7, in <module>
outw.writelines(listecsv)
AttributeError: '_csv.writer' object has no attribute 'writelines'

[afranck64]

mais j'obtiens le message d'erreur suivant en console :

Désolé, j ai commis une légère dans le premier post(avant -edit).

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import csv
 
fichier = open('test.csv','rb')
fichiercsv = csv.reader(fichier, delimiter=',')
out = open("test_edit.csv", "wb")
outw = csv.writer(out)
listecsv = []
for ligne in fichiercsv:
 
	ligne[0] = ligne[0].replace("chr","tot")
	listecsv.append(ligne)
outw.writerows(listecsv)   #La sauvegarde se fait apres modification. :mrgreen: 
out.close()   
fichier.close()

[tom77380]

ça fonctionne merci beaucoup