Discussion :

[Hydro999]

Bonjour,

J'arrive à faire des doc Latex à partir de R.
Attention avec mac pour les accents il faut utiliser

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

\usepackage[applemac]{inputenc}

à la place de

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

\usepackage[latin1]{inputenc}   %Avec PC

Mais j'ai un petit problème voici un exemple de code qui marche tres bien

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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\documentclass[a4paper]{article}
\usepackage[applemac]{inputenc} %Avec Mac
%\usepackage[latin1]{inputenc}   %Avec PC
\begin{document}
Essayons de calculer 2 + 2 :
<<essai2plus2>>=
2 + 2
@
\end{document}

Sauvé sous le nom de mini2.Rnw dans le répertoire ~/R

Quant j'exécute la commande

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Sweave("R/mini2.Rnw")

J'ai le fichier mini2.tex dans le répertoire ~/
~/mini2.tex
Comment faire pour créer le fichier mini2.tex dans un autre répertoire ?

Cdt

[TimoP]

Salut,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

\usepackage[utf8]{inputenc}

fonctionne aussi très bien sur un mac

Pour répondre à ta question suivante, le fichier .tex se met dans le répertoire de travail (getwd() / setwd()) de R, d'ou ~/ par défaut

[Hydro999]

Oui en effet le fichier mini2.tex va dans le répertoire ~/
mais j'aimerai le mettre automatiquement dans un autre, il y a t il moyen de faire ça ?

Cdt

[TimoP]

Il faut changer le répertoire de travail de R.

?setwd

[Hydro999]

En écrivant le code suivant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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setwd("~/R/figure")
 
\documentclass[a4paper]{article}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\begin{document}
 
Essayons de calculer 2 + 2 :
 
<<essai2plus2>>=
2 + 2
@
\end{document}

j'ai un fichier .tex mais dans le répertoire ~/ et non dans le répertoire ~/R/figure

[TimoP]

Si le code est executé depuis R, il faut changer le répertoire de travail DANS R et non DANS LE DOCUMENT.

[Hydro999]

J'ai effectivement un changement,
en écrivant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> setwd("~/R/figure")
> Sweave("R/mini2.Rnw")

j'ai l'erreur suivante:

Writing to file mini2.tex
Processing code chunks ...
Erreur dans SweaveReadFile(file, syntax) :
un fichier Sweave de nom 'R/mini2.Rnw' est introuvable
De plus : Warning message:
In list.files(df, full.names = TRUE, pattern = paste(bf, syntax$extension, :
list.files : 'R' n'est pas un répertoire lisible

mais dans le répertoire

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

~/R/figure

j'ai un fichier mini2.tex mais il est vide

[TimoP]

En fait, je pense que R cherche le fichier Sweave dans /R/figure

il faut que tu te mettes dans /R/

et dans ton fichier Sweave, tu met

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

\SweaveOpts{prefix.string=figures/}

Ce qui aura pour but de mettre les figures dans le dossier /figures/ de /R/, qu'il faut créer avant

Tout ça est dans la doc…

[pitipoisson]

Bonjour,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> setwd("~/R/figure")
> Sweave("R/mini2.Rnw")

...
mais dans le répertoire

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

~/R/figure

j'ai un fichier mini2.tex mais il est vide

Évidemment, tu te places dans le répertoire ~/R/figure et tu lance Sweave avec un chemin relatif faux (et Sweave ne trouve donc pas mini2.Rnw).
Il aurait fallu faire

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> setwd("~/R/figure")
> Sweave("../mini2.Rnw")   # relatif

ou bien

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> setwd("~/R/figure")
> Sweave("~/R/mini2.Rnw")   # absolu

Mais uniquement si tu souhaites que mini2.tex soit également dans le répertoire figure. Sinon, si tu souhaites juste que les images crées soient dans un sous répertoire par rapport à mini2.tex, alors fait comme TimoP te conseille avec les options.

[Hydro999]

C'est magique ça marche.

Merci pour ces trés précieuses indications

Cdt