Production de documents avec R et Latex

**Hydro999** · 17/10/2009, 15h18

Bonjour,

j'ai le problème suivant, pour générer des documents en latex à partir de R j'utilise la fonction :Sweave()
Avec l'exemple qui est donné je génère les fichiers suivant:

Sweave-test-1.tex
Sweave-test-1.R
Sweave-test-1.log
Sweave-test-1-007.pdf
Sweave-test-1-007.eps
Sweave-test-1-006.pdf
Sweave-test-1-006.eps

Puis en utilisant Latex je compile le fichier
Sweave-test-1.tex

et cela me donne l'erreur suivante:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

! LaTeX Error:File 'Sweave.sty' not found.

J'ai lu que sous Windows si R a été installé dans le dossier "Program Files", Latex aura un probleme pour retrouver ce fichier.

Mais je suis sous Mac OSX, je ne devrai donc pas avoir ce problème.
Certains ont ils eu le même problème ?
Et savent ils comment y remédier ?

Cdt

**pitipoisson** · 17/10/2009, 23h09

Bonjour,

Je ne suis pas un habitué des Macs, mais si tu peux faire des liens symboliques à la manière des Unix, j'ai peut-être une solution :

tu trouves le fichier Sweave.sty dans ton répertoire d'installation de R (regarde du côté du sous-répertoire "library" ou quelque chose dans le genre)
créer dans ton arborescence locale ($TEXMFLOCAL) ou utilisateur ($TEXMFHOME, cf. la FAQ LaTeX) un répertoire ./tex/latex/sweave/
et y créer un lien symbolique vers le fichier sweave.sty (si c'est dans le même système de fichier, tu peux même faire un lien direct si l'OS sait gérer ça)
si dans $TEXMFLOCAL, lancer
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
```
texhash
```
avec les droits d'administrateur

Tu peux également te contenter de copier le fichier directement, mais l'avantage des liens, c'est que tu utiliseras la dernière version du fichier après mise à jour de R.

**TimoP** · 18/10/2009, 02h33

Le problème est fréquent avec certaines distribs Mac de LaTeX.

Il faut effectivement aller chercher un Sweave.sty sur le net, le mettre dans un dossier LaTeX, et lancer TexHash.

Et ça roule tout seul.

**pitipoisson** · 18/10/2009, 12h07

Envoyé par TimoP

Il faut effectivement aller chercher un Sweave.sty sur le net,...

Nul besoin, dès lors que le package (R pas LaTeX) Sweave est installé, le fichier Sweave.sty est sur le disque. Il n'est par contre pas nécessairement trouvé par latex, d'où l'idée de créer un lien (commande ln, si possible physique, je viens de voir que ça existait également sous Mac).
J'avais eu ce problème sous GNU-Linux, avec une installation non-standard de TeXlive et ça a parfaitement réglé le problème

Edit: voici ce que ça donne sur mon système

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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3
4
5
$ kpsewhich Sweave.sty
/home/<user>/texmf/tex/latex/Sweave/Sweave.sty

$ ls -l /home/<user>/texmf/tex/latex/Sweave/Sweave.sty
lrwxrwxrwx 1 <user> <user> 35 2009-07-05 14:11 /home/<user>/texmf/tex/latex/Sweave/Sweave.sty -> /usr/share/R/share/texmf/Sweave.sty

**Hydro999** · 18/10/2009, 15h00

Bonjour et merci grâce à vos indications je commence à y voir plus clair.

Mais j'ai encore des problemes.
J'ai créer le répertoire suivant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

/usr/local/texlive/2007/texmf/tex/latex/Sweave

puis fait le lien symbolique

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

ln -s /Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.9/Resources/share/texmf/Sweave.sty /usr/local/texlive/2007/texmf/tex/latex/Sweave

ls -l me donne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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ls -l /usr/local/texlive/2007/texmf/tex/latex/Sweave
lrwxr-xr-x  1 root  wheel  77 18 oct 14:51 Sweave.sty -> /Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.9/Resources/share/texmf/Sweave.sty