Discussion :

[lidaa]

salut

je souhaiterais entourer les os d'une image médicale (ci-joint) en utilisant la méthode des contours actifs (ou snakes) avec OpenCV, j'ai trouvé la fonction cvSnakeImage(...). mais bon, je suis pas encore arrivé à faire épouser mon snake la forme des os. alors si quelqu'un peut m'aider ça serait sympa de son part.

Merci d'avance

[xtra.creativity]

Je serai toi, j'essaierai d'abord avec imageJ (il y a plein de plugins dispo pour les contours actifs) et apres avoir trouve un resultat correct (suivant les parametre etc ...) j'essayerai de le mettre en place avec OpenCV.

[xtra.creativity]

Il faut aussi que tu segmente au mieu ton image histoire qu'il ne reste que les os afin eviter que ton snake s'accroche a un organe ou a la graisse. Avec une egalisation d'histogramme, quelque ajustement de contrastes et un bon threshold fait souvent l'affaire.

[lidaa]

salut,

Merci pour ton aide.

j'ai beaucoup changé les paramètres de mon Snake sous ImageJ afin de trouver les bons paramètres, comme tu as dit, mais toujours le snake ne s'accroche pas aux os de mon image.

est ce que je dois appliquer un prétraitement avant de faire lancer le snake ???

merci d'avance.

[xtra.creativity]

Ba le pretraitement, c'est ce que je t'explique au dessus. Threshold, ..... il faut vraiment que tu essaie d'ellaguer au maximum les parasites. Les os sont facilement segmentable (contrairement au organe) donc tu devrais pas avoir de soucis. Par contre, pourquoi tu utilise un snake pour un os ? Pour un organe je peux comprendre car la morphologie peut changer mais avec un os tu peux savoir ca forme avant de le chercher, non ?

[lidaa]

bonjour,

Par contre, pourquoi tu utilise un snake pour un os ? Pour un organe je peux comprendre car la morphologie peut changer mais avec un os tu peux savoir ca forme avant de le chercher, non ?

justement je peux extraire la forme des os sans utiliser la méthode du contour actif (Snake), mais je l'ai utilisé parce qu'il est très intéressant, pour moi, de savoir quelques points 'clés' du contour.

Pour mon problème;
quand j'applique mon programme sous OpenCV sur une image comme celle-ci (image1) le snake entoure très bien l'objet, mais s'il est appliqué sur mon image médicale, voila ce qui me donne comme résultat final (image2).

merci d'avance.