Discussion :

[Yuki_Hime]

Bonjour
je voudrai votre aide pour parser un fichier texte
ex :
Eukaryota
2
ancestral
n
2759
131567


1474
5358
36329
3702
33154
//la fin est ici

Les champs vides sont non renseignés.

j'ai une fonction me permettant de lire le fichier texte

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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function recup_species($requete){
 $result_requete= "";
 
	$file = fopen("../tmp/".$requete."/descr.txt", "r");
	if ($file) {
		while (!feof($file)) {
		$result_requete= $result_requete.fgets($file, 4096);
	}
	fclose($file);
	}				
return $result_requete;
}

Je fais donc un explode mais celui-ci n'est pas complet car:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

list($_SESSION['requete'][$req]['NAME'],...., ) = explode('\n', recup_species($req));

1/ Vu que chaque terme est sur une ligne, je ne sais pas si en php '\n' est le terme adéquat

2/Les 10 permières lignes du fichier sont constantes, mais la requete faite en background ajoute des nouvelles données et je ne sais pas combien c'est aléatoire
Je voudrais donc stocker toutes ces dernières lignes dans une seule variable du type $_SESSION['requete'][$req]['TAXIDCH']


Pouvez vous m'aider??

[Zwiter]

Salut,

Je ne comprends pas quel et l'interet de passer d'un fichier ou chaque donnée est séparée par un saut de ligne à des données a la chaine, dans une seule variable.

Fait un echo de tes données, et tu pourras te rendre compte du format dans tes variables.

Si tu me decrit plus precisement et concretement ce que tu vas récuperer dans ton fichier, et surtout comment tu places ces données dans ton tableau associatif, je pourai mieux t'aider.

Z.

[Yuki_Hime]

je ne m'y connais pas beaucoup en php, encore moins en perl, alors sorry si j'explique mal.

la passage à la ligne n'est pas vu par explode car quant je fait print de la première variable de la list, tout est stocké dedans
print($_SESSION['requete'][$req]['NAME']);
Eukaryota 2 ancestral n 2759 131567 1474 5358 36329 3702 33154

je fais une requete perl dont la sortie est formatée sous la forme du fichier texte

Eukaryota
2
ancestral
n
2759
131567


1474
5358
36329
3702
33154
(je ne suis pas l'auteur des script en perl, je n'en ai jamais fait, c'est organisé tel que
$name = $tab_line[9];
$dfs = $tab_line[0];
$type = $tab_line[6];
$real = $tab_line[3];
$taxID = $tab_line[1];
$parent = $tab_line[2];
$codePD = $tab_line[4];
$codeHG = $tab_line[5];
$nbProt = $tab_line[7];
$nbDom = $tab_line[8];
le tableau peut continuer de façon aléatoire , je ne connais pas le nombre de ligne qui sera générer par la requete
)

je veux chacune de ces lignes dans une variable de session
que je réutiliserai sur une page web

[s.n.a.f.u]

Bonsoir,

Un code, imaginé à main levée et non testé

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$filename = 'fichier.txt';
$str = file_get_contents($filename);
$tab_line = explode ("\n", $str);
 
$name    = $tab_line[9];
$dfs       = $tab_line[0];
$type     = $tab_line[6];
$real      = $tab_line[3];
$taxID    = $tab_line[1];
$parent  = $tab_line[2];
$codePD = $tab_line[4];
$codeHG = $tab_line[5];
$nbProt   = $tab_line[7];
$nbDom   = $tab_line[8];
 
$reste = array_slice($tab_line, 10);
$taxidch = implode(';', $reste); // ; pris au pif, à toi de choisir

Ca ne marche sûrement pas, mais c'est une piste.

[Yuki_Hime]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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function get_species($requete){// read the files that containt the query's results
 
 $result_requete= "";
 $file = fopen("../tmp/".$requete."/descr.txt", "r") or die("problème oouverture fichier");
 
	if ($file) {
		$cmpt=0;
		while (!feof($file)) {
		$cmpt++;
			if ($cmpt <10){
			$result_requete= $result_requete.fgets($file, 4096);		
			}
			else{							
				$_SESSION['TAXIDCH']=$_SESSION['TAXIDCH'].fgets($file, 4096);				
			}
		}
	if($cmpt>1) $_SESSION['rsok']=TRUE;
 
	fclose($file);
 
return $result_requete;
	}
}

et ça fonctionne !!!!!!!!!! thx