Discussion :

[Yuki_Hime]

Bonjour,

je fais mes pemiers pas en informatique et je me sens un peu décourager par la multitude de language qu'on me demande d'utiliser

je dois faire une interface web en php
et en background je fait des requêtes sur mon terminal

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"fetchdom -b hogenom_v3 -d HBG000010 -fs " % " -t id,kw,la,nd,dr > fetch.txt"

• avec -b hogenom_v3 : ma base de donnée
• -d HBG000010 : retourne la famille de protéine que je veux étudier
• -fs est un filtre séparateur qui me permet de séparer tous les champs que j'ai choisi ( ID, ND, KW,...)
• par " % "

Imaginons qu'un utilisateur fasse une recherche comme celle là sur mon site, la requête me permet de séparer mes champs mais je voudrais enregistrer chacun de ses champs dans une variable que je pourrai afficher sur ma page php

Je ne sais pas du tout comment m'y prendre, j'ai lu de la doc, mais je n'y comprends pas grand chose;

Merci pour votre aide

[Winnt]

Salut,

Code Lecture d'un fichier ligne par ligne (tiré de la doc php) :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?php
$handle = @fopen("/tmp/inputfile.txt", "r");
if ($handle) {
    while (!feof($handle)) {
        $buffer = fgets($handle, 4096);
        echo $buffer;
    }
    fclose($handle);
}
?>

En utilisant ceci tu devrait pouvoir gérer l'affectation de chaque ligne et exploiter chaque ligne par la suite.

[Yuki_Hime]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?php
$requete_fetch = ('/home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b /home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/prodom_v2005 -a '.$requete.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,dr,inn,inntype,ht,spnb > idris_fetch.txt') ;
exec($requete_fetch);
 
$resultat_requete= "";
$handle = fopen("idris_fetch.txt", "r");
if ($handle) {
    while (!feof($handle)) {
         $resultat_requete= $resultat_requete.fgets($handle, 4096);
    }
    fclose($handle);
}
 
 
list($ID, $KW, $LA, $ND, $DR, $INN, $INNTYPE, $HT, $SPND, $CO) = explode(' % ', $resultat_requete) ;
print ("***********".$resultat_requete); ?>

merci ça m'a beaucoup aider j'ai du chercher à adapter un peu mais ça marche super

[Winnt]

Si cela marche c'est parfait

[Yuki_Hime]

ben ya qd meme un petit point noir

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Notice: Undefined offset: 9 in /home/idris/My_php/description_domain.php on line 53

qui apparait correspondant à la ligne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

list($ID, $KW, $LA, $ND, $DR, $INN, $INNTYPE, $HT, $SPND, $CO) = explode(' % ', $resultat_requete) ;

je vois pas trop où est le blem.......???

[Winnt]

Salut,

Fait un "echo" de chaque ligne récupérée avant traitement.
donc avant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

list($ID, $KW, $LA, $ND, $DR, $INN, $INNTYPE, $HT, $SPND, $CO) = explode(' % ', $resultat_requete) ;

Et vérifie que tu as bien toutes tes variables dans cette ligne. Je dirais que certaines lignes ne sont pas complètes.