je ne mets pas de signe =
J'execute le jar sous linux, sur un serveur multi proc avec plein de ram, et sans ces 2 dernieres options.
Voici mes options, qui a la basent etaient le plus large possible. Maintenant, les options 'filtre' telles que gcrange, tmrange, maxpolyx... sont inutilent avec l'option -hpv que j'ai rajouté.
java -jar YODA_HPV.jar -dfile all.fasta -ofile all_oligo_25 -olength 25 -maxconsechits 99999 -maxpercentid 100 -tmrange 200 -gcrange 200 -maxpolyx 20 -dwindow 20 -hwindow 7 -hstringency 7 -cover -showparams -mpps 99999 -hpv -revcomph -dnaconc 1000 -saltconc 1000
Z.
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