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ImageJ Java Discussion :

[ImageJ] extraire les valeurs des pixels d'une image DICOM en utilisant ImageJ


Sujet :

ImageJ Java

  1. #1
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    Par défaut [ImageJ] extraire les valeurs des pixels d'une image DICOM en utilisant ImageJ
    Bonjours à tous,
    Je travaille sur la compression d’image médicale 4D, les images à traités sont de type DICOM et je dois en extraire les valeurs des pixels de chaque coupe pour cela j'utilise la bibliothèque ImageJ avec eclipse.
    Je cherche comment extraire les valeurs des pixels en utilisant ImageJ, Merci d’avance pour votre aide.

    Je suis bloqué, si vous pouvez m'aider pour se premier pas

    J'ai oublié de mettre le bout de code:
    Code Java : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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     DICOM dcm = new DICOM();
            dcm.open("");
           if (dcm.getWidth()==0)
                    IJ.log("Error opening '"+""+"'");
           else
                   dcm.show();
    for(x=1;x<dcm.getWidth();x++)
    	     for(y=1;y<dcm.getHeight();y++)
    	    System.out.println ("la valeur"+dcm.getPixel(x, y));
    J'obtiens des valeurs de se type "[I@1ffb8dc".

  2. #2
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    Citation Envoyé par li_la Voir le message
    J'obtiens des valeurs de se type "[I@1ffb8dc".
    Jusque là c'est normal, car la méthode getPixel renvoie un tableau.

    essaye d'afficher ca:

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    System.out.println ("la valeur " + java.util.Arrays.toString( dcm.getPixel(x, y) ) );
    ALGORITHME (n.m.): Méthode complexe de résolution d'un problème simple.

  3. #3
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    Avec la méthode getpixel j'obtiens un tableau de 4 valeurs ex:[32818, 0, 0,0] On peut utiliser la classe ImageProcessor pour obtenir les valeurs des pixels
    Code Java : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    DICOM dcm = new DICOM();
            dcm.open("");
           if (dcm.getWidth()==0)
                    IJ.log("Error opening '"+""+"'");
           else
                   dcm.show();
           ImageProcessor ip = dcm.getProcessor();
           for(x=1;x<dcm.getWidth();x++)
      	     for(y=1;y<dcm.getHeight();y++)
      	    System.out.println ("la valeur"+ip.getPixel(x, y));
    Mais les valeurs obtenus sont trés grande ex :31835, je travaille sur des images en niveau de gris 16 bits. Es ce que c'est les valeurs des pixels avec les quels je dois travailler, d'abitude je travaille avec les valeurs comprise entre 0 et 255.

  4. #4
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    Citation Envoyé par li_la Voir le message
    Mais les valeurs obtenus sont trés grande ex :31835, je travaille sur des images en niveau de gris 16 bits. Es ce que c'est les valeurs des pixels avec les quels je dois travailler, d'abitude je travaille avec les valeurs comprise entre 0 et 255.
    8 bits ==> 2^8 valeurs possibles ==> valeurs entre 0 et 255

    16 bits ==> 2^16 valeurs possibles ==> valeurs entre 0 et 65535
    ALGORITHME (n.m.): Méthode complexe de résolution d'un problème simple.

  5. #5
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    Merci pseudocode pour ces explications

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