Discussion :

[myosotis29]

Bonjour à vous tous,
Je suis novice en matière de programmation étant donnée que je suis biologiste. Je ne connais qu'un seul langage, Python, dont je ne connais que les bases. Voilà, je pose mon problème: j'ai plus de 1000 gènes dont je veux récuperer les annotations à partir de la fiche genbank (je sais parser ce genre de fichier). J'ai utilisé un outil de data mining (Biomart) mais je n'obtiens pas toutes les informations dont j'en ai besoin.
Est-ce que qu'un peut m'aider? ça fait des semaines que je tourne en rond.
Merci

[Jasmine80]

Regarde ce module.

http://search.cpan.org/~lds/Boulder-...der/Genbank.pm



Il y a également d'autres modules pouvant être utiles sur le CPAN

http://search.cpan.org/search?query=genbank+&mode=all

[myosotis29]

Merci Jasmine pour ton coup de pouce, mais malheureusement, je ne comprends pas le Perl . J'essayerai de le traduire en Python . Pour l'instant, je suis en train de découvrir Biopython. On verra ce que ça donne et si ça résoud mon problème

[Jasmine80]

Quoi de plus normal pour un biologiste que d'utiliser python. J'entends encore mon frère me vanter les mérites de ce langage.

Personne n'as pu t'aider dans la section python de ce forum?
http://www.developpez.net/forums/f96...s/python-zope/