Discussion :

[FloFox]

Bonjour à tous,

Je travaille actuellement sur un projet de programmation sous Visual C++ 6 avec la librairie OpenCV, pour le traitement d'images médicales.

J'aimerai savoir s'il existe une fonction permettant d'extraire uniquement les données "image" contenues dans un fichier DICOM.

Je sais qu'il existe de nombreux programmes qui permettent de visualiser ou de convertir ce type de fichiers, j'en déduis donc qu'il est possible d'en extraire les differents types de données.

Quelqu'un pourrait-il me donner une solution ou bien une piste a suivre ?

Merci d'avance !

[Matthieu Brucher]

Il existe des bibliothèques pour cela, en revanche aucune n'est capable de lire toutes les images DICOM tellement le standard est bien fait...

[Jerome Briot]

tellement le standard est bien fait...

Le problème ne vient pas du standard mais des fabricants de machines qui usent et abusent des Private Tag et autres joyeux particularismes.

Pour les pistes à suivre... je ne peux que conseiller le forum anglophone comp.protocols.dicom, le site de Sébastien Barré et le site de David Clunie.

Et bien sur... la meilleure et la plus complexe : la norme

Sinon, peux-tu être plus précis sur ce que tu entends pas "données images" ?

[FloFox]

Merci pour ces premières pistes de recherche !

Dutmatlab a écrit :
Sinon, peux-tu être plus précis sur ce que tu entends pas "données images" ?

Ce que j'entends par "données images", c'est la partie du fichier DICOM qui contient la matrice de données correspondant à l'image médicale (échographie, radiographie, ...) à la difference des "données patient" (Nom, Prénom, ...).

Apparement, d'après ce que j'ai pu comprendre, l'ensemble des données sont séparées par des en-têtes spécifiques (Tags).

Ce que je cherche a faire c'est d'extraire uniquement cette partie du fichier DICOM pour effectuer mon traitement des images.

[Jerome Briot]

Pour faire simple, un fichier Dicom est divisé en deux parties : l'entête suivie de la partie où sont codés les pixels. Malheureusement, il est très souvent nécessaire de lire l'entête pour savoir comment lire les pixels.

Regardes ce lien qui explique bien les infos contenues dans l'entête : http://www.sph.sc.edu/comd/rorden/dicom.html

[FloFox]

Regardes ce lien qui explique bien les infos contenues dans l'entête : http://www.sph.sc.edu/comd/rorden/dicom.html

En effet, c'est très bien expliqué.

Avec le chapitre 7 de la partie 10 de la norme (ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2007/07_10pu.pdf), j'ai un peu mieux compris la structure du format DICOM.

Cependant, l'extraction des "images" reste plutot compliquée a mettre en oeuvre.

Je vais tenter de trouver une librairie open source qui peut effectuer ce type d'opération.

Encore merci pour votre aide !

[Jeromnimo]

Bonjour,

pour extraire simplement des données d'un fichier DICOM quel qu'il soit (car ce ne sont pas forcement des images...), tu peux utiliser la bibliothèque DCMTK (http://dicom.offis.de/dcmtk.php.en).
Elle te permettra de récupérer facilement les informations contenues dans les différents qui te sont nécessaires.

Bon courage.

[stranger]

Tu peu utiliser la bibliothéque ITK aussi, dans la Doc du site ils expliquent comment lire une Image DICOM et plus précisement récuperer les données des images (et c'est ce que tu veu faire je pense ).
Voilà un lien si ca t'interesse : http://www.itk.org/HTML/Documentation.htm