Discussion :

[Grasshoper]

Bonjour à toutes et à tous,

Je tiens tout d'abord à souligner que je suis un grand novice en R. Désolé si ma question est simplette.
Je lance des calculs avec un code R sur un serveur de calcul. Pour se faire, j'ai un script R qui est chargé dans une image docker qui est ensuite envoyée sur le serveur de calcul. Dans ce script R j'installe des packages, typiquement:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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install.packages("lme4")
install.packages("dplyr")
install.packages("Matrix")
install.packages("parallel")
install.packages("rsq")

Et ca fonctionne très bien.

Par contre, j'ai un soucis avec l'installation d'un autre package:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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install.packages("LongituRF")
install.packages("caret")
install.packages("party")
library("dplyr")
 
Error in library(LongituRF) : there is no package called ‘LongituRF’
Execution halted

A noter que le code fonctionne en local sur ma machine, et que les packages sont bien installés comme ça devrait l'être. Par contre quand j’exécute ce script R via l'image docker sur laquelle il est installé, ca me met cette erreur. Pouvez-vous m'aiguiller? Je ne sais pas trop ou chercher. J'ai essayé d'inclure une URL pour aller chercher le package, par exemple:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

install.packages('LongituRF', dependencies = TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')

mais sans plus de succès...

Merci!

[Grasshoper]

J'ai trouvé, c'était une question de dépendance à d'autres packages sous une version de R inférieure à l'actuelle. La solution pour moi a été d'utiliser ces lignes:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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urlPackage <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/randomForest/randomForest_4.6-12.tar.gz"
install.packages(urlPackage, repos=NULL, type="source") 
install.packages('LongituRF', dependencies = TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')

Donc en spécifiant le chemin exact de l'archive dans urlPackage.

Je marque comme résolu.