Discussion :

[Dorhub]

Bonjour,

Je possède une liste

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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lig-a-20.pdb
lig-a-80.pdb
lig-a-20.txt
lig-a-80.txt

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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lig-a-20.pdb:
Model 1
Model 2
 
lig-a-20.txt:
score 1 
score 2
score 3
 
lig-a-80.pdb:
Model 1
Model 2
Model 3
 
 
lig-a-80.txt:
score 1
score 2
score 3
score 4
score 5

Il n'y a plus de score que de model par fichier correspondants. L'idée ce serait de supprimer les scores en trop dans les fichiers txt. en fonction du nombre de model correspondant dans le fichier .pdb et pas " deux au hasard" mais la fin du fichier en trop dans le fichier txt.

Je fais une boucle for, mais la boucle for va travailler comme si une matrice et ce n'est pas du tout ça


Après promis c'était ma dernière question

[disedorgue]

exemple pour un couple de fichier pdb/txt (à toi de gérer la boucle) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ cat l1.pdb
Model 1
Model 2
Model 3
 
$ cat l1.txt
score 1
score 2
score 3
score 4
score 5
$ sed -n 's/Model/score/p' l1.pdb | grep -f - l1.txt
score 1
score 2
score 3

[N_BaH]

avec join.
mais il faut quand même encore faire une boucle for sur un Développement de chemins !

ou bien est-ce encore un exercice d'algorithmique à faire en 100% shell ?

[disedorgue]

peut-on considérer ce genre de ligne comme juste du bash

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

eval "$(printf "sed -n 's/Model/score/p' %s | grep -f - %s\n" l*)"

[Dorhub]

Merci

Mais si tu avais cela

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ cat l1.pdb
Model 1
Model 2
Model 3
 
$ cat l1.txt
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Juste à partir de l'indice

[disedorgue]

ça s'appelle un changement de spécifications...

D'où, l'intérêt d'être clair dans l'exposé du problème.

Donc, expose correctement le problème et les formats de tes fichiers qui ne prête pas à confusion et après on pourra éventuellement t'aider.

[Dorhub]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ cat l1.pdb
Model 1
Model 2
Model 3
 
$ cat l1.txt
text text text
text text
   1 text text text
   2 text text text
   3 text text text
   4 text text text
   5 text text text

Pour modifier l1.txt en

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ cat l1.txt
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[Flodelarab]

Bonjour

Moi, je sais faire. Et toi, comment ferais-tu à la main ?