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ImageJ Java Discussion :

Erreur macro "Multichannel image is required"


Sujet :

ImageJ Java

  1. #1
    Candidat au Club
    Femme Profil pro
    Technicienne de laboratoire
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    novembre 2020
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    Par défaut Erreur macro "Multichannel image is required"
    Bonjour,
    je suis en train de créer une macro mais je suis bloquée rapidement lorsque je dois "spliter" les canaux, un message d'erreur m'apparaît :
    Multichannel image is required.
    Ce sont pourtant bien des images multicanaux...
    Voici le début ma macro, si vous pouvez m'aider svp ?

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    run("Close All");
    roiManager("reset");
    run("Clear Results");
     
     
    dir = getDirectory("Choose a Directory ");
    Filelist = getFileList(dir);
     
    for(m=0;m<Filelist.length;m++)
    	{
     
    	name=Filelist[m];
    	path=dir + name;
     
    	if (endsWith(name, ".tif"))
    		{
    		open(path);
     
     
    		run("8-bit");
    		run("Properties...", "channels=1 slices=1 frames=1 pixel_width=84.6668 pixel_height=84.6668 voxel_depth=25400.0508");
    		run("Split Channels");

  2. #2
    Membre régulier Avatar de Tchoukatroc
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    Par défaut
    Bonjour,

    Je pense que c'est la ligne "image properties" qui pose problème. En testant la fonction "image properties" sur un stack multichannel, si on met comme paramètres "channels=1 slices=1 frames=1" comme dans la macro, la fonction renvoie un message d'erreur. Je pense qu'il faut que les paramètres de la fonction soit identiques aux paramètres du stack. Il est possible de récupérer les paramètres du stack avec la fonction "getDimensions(width, height, channels, slices, frames)".
    Il faudrait tester la macro sans cette ligne pour voir si l'erreur vient de cette ligne. Si c'est le cas, récupérer les paramètres du stack avec getDimensions et les mettre comme paramètres de la fonction "image properties".

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