Discussion :

[weecrew]

Bonjour à tous,
Je suis étudiant en neuroscience et je dois analyser des images de microscopie sur lesquelles apparaissent des neurones en fluorescence. Je dois donc quantifier cette fluorescence et donc compter les pixels correspondant a cette fluo sur l'image
Je souhaite donc créer un script en ce sens.
avez vous des conseils a me donner pour organiser mon script et comment bien le démarrer. le but étant d'automatiser ce comptage pour chaque image afin de pas avoir a refaire le script pour chaque image. Donc créer une loop afin de le faire.
Simplement déjà par quoi commencer?
Merci à vous

[zancrows]

Bonjour,

pour l'analyse de votre image je peux vous conseiller de regarder du côté de Pillow -> https://pillow.readthedocs.io/en/stable/
Avec ce module vous pourrez travailler sur les pixels.