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Shell et commandes GNU Discussion :

Lister fichiers par leurs versions en BASH


Sujet :

Shell et commandes GNU

Vue hybride

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  1. #1
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    Par défaut Lister fichiers par leurs versions en BASH
    Bonjour

    Est ce que quelqu'un aurait une idée de comment trier des fichiers en fonction de leur version :

    Input
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    5
    6
    7
    8
    9
    AB-00017938-1_r264.mol2
    AB-00058387-1_r271.mol2
    AB-00024683-6_r265.mol2
    Fr-PPIchem_05919-1_r266.mol2
    Fr-PPIchem_09462-1_r263.mol2
    AB-00047041-1_r267.mol2
    AB-00060649-2_r268.mol2
    AB-00067275-1_r269.mol2
    AB-00027368-10_r270.mol2
    Output
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    5
    6
    7
    8
    9
    Fr-PPIchem_09462-1_r263.mol2
    AB-00017938-1_r264.mol2
    AB-00024683-6_r265.mol2
    Fr-PPIchem_05919-1_r266.mol2
    AB-00047041-1_r267.mol2
    AB-00060649-2_r268.mol2
    AB-00067275-1_r269.mol2
    AB-00027368-10_r270.mol2
    AB-00058387-1_r271.mol2
    J'ai essai avec un mais cela ne fonctionne pas correctement


    Merci beaucoup

  2. #2
    Expert confirmé Avatar de disedorgue
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    Non, pas possible avec ls seul, voici une potentiel solution mais sur chaine pas sur numeric (et spécifique gawk) ...
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    printf "%s\n" * | gawk -F '_' 'BEGIN{PROCINFO["sorted_in"]="@val_str_asc"}{A[$0]=$NF}END{for (i in A) print i}'

  3. #3
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    Par défaut
    Merci beaucoup mais je ne possède pas gawk. Effet l'idée serait de lister en fonction du " r*** " ou en regardant la fin. Le le fait presque mais il manque un petit truk

  4. #4
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    Par défaut
    Le faire presque ça ne veut rien dire, le -t de ls c'est pour le time du fichier, il n'a rien à voir avec le nom du fichier.

    Voici une autre solution:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    printf '%s\n' * | sed 's/.*_r\([0-9]\+\)\.mol2/\1 &/' | sort -n -k1 | sed 's/^[0-9]\+ //'
    Et même si on ne doit pas utiliser ls dans du scripting, tu peux remplacer le printf '%s\n' * par ls -1 ou juste ls si sa sortie n'est pas lié directement au terminal.

  5. #5
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    Par défaut
    il manque un petit truk
    au moins un : que tu lises le man pour com/ap-prendre ce que signifient les options que tu utilises.

    mais de toutes façons, comme l'a dit disedorgue, ls n'est pas du tout la solution.
    N'oubliez pas de consulter les cours shell, la FAQ, et les pages man.

  6. #6
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    Par défaut
    Bonjour

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    10
    $ while read ligne;do num="${ligne##*r}";echo "$ligne:${num%.mol2}";done < fichier.txt | sort -t: +1n | sed 's/:[^:]*$//'
    Fr-PPIchem_09462-1_r263.mol2
    AB-00017938-1_r264.mol2
    AB-00024683-6_r265.mol2
    Fr-PPIchem_05919-1_r266.mol2
    AB-00047041-1_r267.mol2
    AB-00060649-2_r268.mol2
    AB-00067275-1_r269.mol2
    AB-00027368-10_r270.mol2
    AB-00058387-1_r271.mol2

  7. #7
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    Par défaut
    Il s'agit d'une liste de fichiers avec l'extension .mol2, je dois prendre leur nom depuis un répertoire. Ce n'est pas un fichier qui contient une liste de noms.

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