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ImageJ Java Discussion :

Isoler les porosités externes d'un échantillon


Sujet :

ImageJ Java

  1. #1
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    Par défaut Isoler les porosités externes d'un échantillon
    Bonjour
    je travaille sur la séquence d'image d'une tomographie d'une éprouvette comprenant des défauts (porosités) internes et externes (en contact avec l'air ambiant). J'aimerais isoler d'une part les défauts internes et d'autre part les défauts externes pour les analyser.

    J'ai isolé les défauts internes avec un Fill Holes et une soustraction d'images, mais je bloque pour les externes.
    J'ai appliqué un Threshold sur la séquence d'images et je voudrais faire un Convex Hull, le "remplir" pour boucher toutes les porosités et faire une soustraction d'images avec le Fill Holes que j'ai déjà fait, pour obtenir les porosités externes.

    J'ai essayé pleins de choses comme le Convex Hull puis le Fill dans le menu Edit->Sélection->Convex Hull, mais le soucis étant que l'éprouvette n'a pas tout à fait la même section sur toutes les images de la séquence, donc mon Convex Hull appliqué à partir de l'image n°1 ne s'adapte pas à toute la séquence.
    J'ai également essayé d'autres plugins trouvés dans la documentation (Convex Hull 3D, Hull and Circle...) mais rien de concluant. Je débute totalement avec ce logiciel et je ne sais plus où chercher

    Merci d'avance,
    Laura

  2. #2
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    Bonjour Laura et tous les membres du forum intéressés pour m'aider,

    Je reprends la première partie de ton problème :
    "J'ai isolé les défauts internes avec un Fill Holes et une soustraction d'images, mais je bloque pour les externes.
    J'ai appliqué un Threshold sur la séquence d'images et je voudrais faire un Convex Hull, le "remplir" pour boucher toutes les porosités et faire une soustraction d'images avec le Fill Holes que j'ai déjà fait, pour obtenir les porosités externes"

    Peux-tu me dire comment tu as fais davantage en détails stp ?

    J'ai une problématique un peu similaire. Voilà l'image microscopique avec les "pores" en noir (matrice cimentaire d'un béton) + l'image après seuillage + l'image après seuillage et filtrages (bruit de fond + contraste/brillance). Sauf que l'image finale ne me convient pas, je voudrais avoir les "pores" bien nets cad bien isolés les uns des autres (une segmentation ?) et ensuite pouvoir les remplir avec la fonction "fill holes" mais je ne vois pas comment faire..

    Bien évidemment, je suis preneuse d'une autre méthode pour traiter mon image initiale. Le but étant que je récupère un % de porosité surfacique (l'aire noire de mes "pores" par rapport à l'aire initiale de mon image).
    Images attachées Images attachées    

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