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Calcul scientifique Python Discussion :

python et fichier txt


Sujet :

Calcul scientifique Python

  1. #1
    Futur Membre du Club
    python et fichier txt
    Bonsoir
    Je souhaiterais placer dans des listes les éléments du fichier bille14.txt (obtenu à partir d'un logiciel de pointage vidéo "atelier scientifique")
    Il apparait dans ce fichier (quand je l’édite dans notepad++) la chaine "NUL" après la dernière donnée.

    Si je supprime cette chaine, mon script python (bille20.py) fonctionne et me permet de récupérer les données séparées par des tabulations.


    Je souhaiterais donc automatiser cette tache dans mon script python ...


    J'ai cherché en vain , voila pourquoi je vous demande de l'aide.
    D'avance merci


  2. #2
    Membre expérimenté
    Joins ton fichier de données ainsi que ton programme, ce sera plus simple de t'aider. Ce n'est pas compliqué.
    Pas d'aide par mp.

  3. #3
    Modérateur

    Salut,

    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    Je souhaiterais donc automatiser cette tache dans mon script python ...
    Il suffit de lire le fichier et de passer la chaine de caractères récupérée moins le dernier caractère à numpy.genfromtxt.
    Mais il serait mieux d'apprendre à faire que Notepad+ n'ajoute pas ce dernier caractère.

    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  4. #4
    Futur Membre du Club
    Bonjour
    Merci pour vos réponses et désolé pour le retard mais je me suis absenté pour le nouvel an.
    Pour répondre à Marco056 j'ai mis en PJ dans le message le fichier texte (bille14.txt) et mon début de script (bille20.py).
    Te faut-il autre chose ?
    Merci .

  5. #5
    Membre expérimenté
    Ce que je fais, c'est que j'ouvre ton fichier txt avec libroffice et je l'enregistre en csv.
    Ensuite :
    Code :Sélectionner tout -Visualiser dans une fenêtre à part
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    import matplotlib.pyplot as plt
    import csv
     
    file = "bille14.csv"
     
    ###########################################################
    ################## sans frottement ########################
    temps=[]
    absc_1=[]
    ordo_1=[]
    # lecture du fichier file
    with open(file,newline='') as fich:
        f = csv.reader(fich,delimiter="\t")
        for ligne in f:
            # première colonne (colonne 0)
            temps.append(ligne[0])
            # deuxième colonne (colonne 1)
            absc_1.append(ligne[1])
            # troisième colonne (colonne 2)
            ordo_1.append(ligne[2])
    # si besoin, on remplace les virgules par des points et on transtype 
    # en réel en enlevant la première ligne
    #new_temps = [float(el.replace(',','.')) for el in temps[1:]]
    new_temps = [float(el) for el in temps[2:]]
    new_absc = [float(el) for el in absc_1[2:]]
    new_ordo = [float(el) for el in ordo_1[2:]]
    print(new_temps,new_absc,new_ordo)
    Pas d'aide par mp.

  6. #6
    Futur Membre du Club
    merci marco056

    wiztricks , peux-tu m'en dire plus sur "lire le fichier et de passer la chaine de caractères récupérée moins le dernier caractère" en m’indiquant par exemple la suite des instructions à utiliser ?

    merci d'avance

  7. #7
    Modérateur

    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    wiztricks , peux-tu m'en dire plus sur "lire le fichier et de passer la chaine de caractères récupérée moins le dernier caractère" en m’indiquant par exemple la suite des instructions à utiliser ?
    open('bille14.txt').read()[:-1]

    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  8. #8
    Futur Membre du Club
    Citation Envoyé par wiztricks Voir le message
    open('bille14.txt').read()[:-1]
    cela me donne bien les données (je les ai affichées en faisant print(open("bille14.txt").read()[:-1])) ... mais je suis bloqué pour en faire des listes avec numpy.genfromtxt.
    est-ce possible d'avoir encore un coup de pouce?
    merci

  9. #9
    Modérateur

    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    est-ce possible d'avoir encore un coup de pouce?
    numpy.genfromtxt(open("bille14.txt").read()[:-1], delimiter=....)

    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  10. #10
    Futur Membre du Club
    Citation Envoyé par wiztricks Voir le message
    numpy.genfromtxt(open("bille14.txt").read()[:-1], delimiter=....)
    J'ai tapé :
    Code :Sélectionner tout -Visualiser dans une fenêtre à part
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    import numpy as np
    t,x,y=np.genfromtxt(open("bille14.txt").read()[:-1],delimiter="\t",skip_header=2,unpack=True)
    print(t)
    print(y)


    Mais cela ne fonctionne pas (voir message d'erreur)


  11. #11
    Modérateur

    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    Mais cela ne fonctionne pas (voir message d'erreur)
    Normal que çà ne fonctionne pas.
    Ouvrez la documentation que je vous ai déjà indiqué, regardez ce qui est suggéré dans ces cas là et essayez d'en faire quelque chose.

    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  12. #12
    Futur Membre du Club
    désolé mais j'ai atteint mes limites ...
    tant pis

  13. #13
    Membre expérimenté
    Code :Sélectionner tout -Visualiser dans une fenêtre à part
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    import numpy as np
    import matplotlib.pyplot as plt
    from io import StringIO
     
    fich = open('bille14.txt').read()[:-1]
    pointage = np.genfromtxt(StringIO(fich),\
    delimiter='\t',invalid_raise=False,skip_header=2) 
     
    t=pointage[:,0]     #lecture des dates t issues de la première colonne(notée 0)du fichier csv; les données se retrouveront dans un tableau d'une ligne#
    x=pointage[:,1]     #lecture des abscisses x issues de la première colonne(notée 1)du fichier csv; les données se retrouveront dans un tableau d'une ligne#
    y=pointage[:,2]     #lecture des ordonnées y issues de la deuxième colonne(notée 2)du fichier csv; les données se retrouveront dans un tableau d'une ligne#
     
     
    print("Dates t en s :",t)
    print("Abscisses x en m :",x)
    print("Ordonnées y en m :",y)


    et pour résumer, 2 options parmi d'autres :
    Code :Sélectionner tout -Visualiser dans une fenêtre à part
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    import numpy as np
    import csv
    import matplotlib.pyplot as plt
    from io import StringIO
     
    fich = open('bille14.txt').read()[:-1]
    pointage = np.genfromtxt(StringIO(fich),\
    delimiter='\t',invalid_raise=False,skip_header=2) 
     
    t=pointage[:,0]     #lecture des dates t issues de la première colonne(notée 0)du fichier csv; les données se retrouveront dans un tableau d'une ligne#
    x=pointage[:,1]     #lecture des abscisses x issues de la première colonne(notée 1)du fichier csv; les données se retrouveront dans un tableau d'une ligne#
    y=pointage[:,2]     #lecture des ordonnées y issues de la deuxième colonne(notée 2)du fichier csv; les données se retrouveront dans un tableau d'une ligne#
     
     
    print("Dates t en s :",t)
    print("Abscisses x en m :",x)
    print("Ordonnées y en m :",y)
     
     
    file = "bille14.csv"
     
    temps=[]
    absc_1=[]
    ordo_1=[]
    # lecture du fichier file
    with open(file,newline='') as fich:
        f = csv.reader(fich,delimiter="\t")
        for ligne in f:
            # première colonne (colonne 0)
            temps.append(ligne[0])
            # deuxième colonne (colonne 1)
            absc_1.append(ligne[1])
            # troisième colonne (colonne 2)
            ordo_1.append(ligne[2])
    # si besoin, on remplace les virgules par des points et on transtype 
    # en réel en enlevant les deux premières lignes
    #new_temps = [float(el.replace(',','.')) for el in temps[2:]]
    new_temps = [float(el) for el in temps[2:]]
    new_absc = [float(el) for el in absc_1[2:]]
    new_ordo = [float(el) for el in ordo_1[2:]]
    print("t : ",new_temps,'\n', 'x : ',new_absc,'\n', 'y : ',new_ordo)
    Pas d'aide par mp.

  14. #14
    Futur Membre du Club
    merci cela fonctionne effectivement ... l'apport de StringIo m'échappe un peu cependant.

    j'aurais bien aimé creuser la solution de w... mais je ne vois pas ce qui cloche ...

  15. #15
    Membre expérimenté
    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    merci cela fonctionne effectivement ... l'apport de StringIo m'échappe un peu cependant.

    j'aurais bien aimé creuser la solution de w... mais je ne vois pas ce qui cloche ...
    C'est sa solution que j'ai creusée.
    Pas d'aide par mp.

  16. #16
    Futur Membre du Club
    mais du coup que fait StringIo ?

    à priori W... ne m’orientait pas vers StringIo ... il m'orientait plutôt vers les paramètres de genfromtxt spécifiés dans la page qu'il m'avait indiquée

  17. #17
    Membre expérimenté
    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    mais du coup que fait StringIo ?
    Il permet de régler le Pb
    Bon, en fait, je ne connaissais pas ce module : c'est l'erreur déclenchée qui m'a permis de creuser.
    https://docs.python.org/3/library/io.html
    Pas d'aide par mp.

  18. #18
    Modérateur

    Citation Envoyé par nsmax Voir le message
    à priori W... ne m’orientait pas vers StringIo ... il m'orientait plutôt vers les paramètres de genfromtxt spécifiés dans la page qu'il m'avait indiquée
    Si vous aviez lu les exemples données dans la page de documentation vous y auriez vu passer StringIO.

    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  19. #19
    Futur Membre du Club
    Effectivement je me suis focalisé sur les paramètres et pas sur les exemples mentionnant "StringIo".
    Merci beaucoup à vous deux.